I funghi acquatici (o funghi anfibi ) che formano l' idromicoflora , sono un gruppo ecologico più che tassonomico . Con rarissime eccezioni, sono microscopici e unicellulari, e ancora relativamente sconosciuti sebbene diffusi. Rilevati per la prima volta da studi biomolecolari su microeucarioti acquatici, sono stati trovati anche nei fondali marini profondi , nei sistemi idrotermali profondi.
Negli ecosistemi marini e d'acqua dolce hanno un importante ruolo ecologico perché sono i principali elementi di decomposizione legnosi ed erbacei grazie alla loro capacità di degradare la lignocellulosa e contribuire alla decomposizione di animali morti e rifiuti animali. I servizi ecosistemici globali che forniscono sono tuttavia ancora poco conosciuti.
Alcuni microfunghi acquatici sono importanti patogeni di piante e animali (anche in mare). Altri o gli stessi hanno sviluppato relazioni simbiotiche con altri organismi marini o d'acqua dolce.
Sono organismi capaci di svolgere il loro intero ciclo di sviluppo sott'acqua ( acqua dolce , salmastra o marina a seconda della specie) o all'interno o all'esterno di organismi acquatici viventi che parassitano o con i quali talvolta mantengono uno stretto rapporto simbiotico ( Micoficobiosi ). Ji NY & Wang BG nel 2016 parlano di funghi “alguicoli” (algicoli per gli anglofoni) per designare i funghi che sviluppano una simbiosi mentre vivono all'interno di un'alga.
Anticamente erano classificate come "piante inferiori" e/o come "funghi imperfetti" ( Fungi imperfecti ). Sono “ funghi ” ( principalmente ifomiceti e ascomiceti ) di varia origine filogenetica, quindi non formanti un unico e coerente gruppo o taxon . Ora sono inventariati e studiati dall' “idromicologia” e in mare nell'ambito della “micologia marina”. Ad oggi, le loro funzioni negli ecosistemi e i servizi ecosistemici che forniscono sono ancora poco conosciuti, fatta eccezione per alcune specie patogene o utili che sono meglio studiate. Svolgono un ruolo importante negli ecosistemi, nel ciclo del carbonio e in alcune malattie.
Ci sono forse diversi milioni di specie microscopiche, così come alcune specie di licheni acquatici ). Viceversa, all'interno dei “ macromiceti ” (precedentemente noti anche come “ funghi superiori ”) solo due specie (rare e non correlate) sono state finora identificate come parzialmente o forse totalmente acquatiche :
Entrambe le specie degradano il legno morto sommerso o forse altre fonti ricche di cellulosa o lignina. Raramente sono stati osservati, e sempre in acqua dolce . In declino in contesti antropizzati, potrebbero avere un valore bioindicativo.
Il sottomarino micro-fungo è molto discreto e quasi sempre invisibili a occhio nudo (perché è spesso microscopica e non pigmentati). Contribuisce efficacemente alla degradazione della necromassa sommersa ( legno morto , lettiera subacquea di foglie morte), dei cadaveri , di parte della materia organica sedimentata, nonché delle deiezioni presenti nell'acqua, su superfici dure o sul sedimento sommerso o umido.
Alcune specie vivono anche sulle parti emerse di piante palustri morte ( ad esempio canne ).
Costituisce una parte significativa della “ micobiodiversità ”, a sua volta a lungo ignorata e poi sottovalutata.
Svolge quindi un ruolo importante nel ciclo del carbonio . I microfunghi acquatici più spettacolarmente "visibili" sono i Leptomitus, che abbondano in alcune acque inquinate da materia organica . Tuttavia, questi funghi filamentosi sono indistinguibili ad occhio nudo dai filamenti batterici formati esclusivamente da Sphaerotilus (che abbondano nelle stesse condizioni). Inoltre, questi funghi e batteri spesso coesistono in questi ambienti inquinati. Un secondo Wurtz, i rifiuti di caseifici favoriscono funghi, eventualmente in stand puri nel corso d'acqua, nonché ma in misura minore rispetto amido fabbriche o amido fabbriche , mentre cartiere , zuccherifici , distillerie e fogne favoriscono le sphaerotilus batteri .
Nei corsi d'acqua ben aerati, sono i funghi acquatici ( principalmente oomiceti e chitridiomiceti ) che contribuiscono maggiormente a degradare i miliardi di foglie morte che cadono nell'acqua ogni anno (ma non nelle paludi povere di ossigeno dove i batteri li dominano).
Microfonge è anche una delle fonti di degrado degli scafi delle navi in legno e degli accessori subacquei in legno. Il microfonge acquatico contiene un gran numero di specie, spesso molto poco appariscenti e microscopiche. È ancora poco compreso.
Le specie acquatiche "inferiori", spesso filamentosi e precedentemente classificati come Phycomycetes , possono formare biofilm o in acqua inquinata grandi flocculi miceliari (che, a seconda dei casi, evocano giù, scaglie o filamenti spesso hanno l'aspetto di lanugine). 'Un " coda di pecora" o una "coda di agnello sommersa" , sviluppandosi ad uno spessore che può raggiungere una ventina di cm o più. Secondo Wurtz, questi accumuli filamentosi sono particolarmente caratteristici del Leptomito se si è a valle di un caseificio. Sono difficili da identificare osservazione, perché sott'acqua producono pochissimi organi riproduttivi (anteridi, oogonia, spore a riproduzione asessuata necessarie per la loro esatta identificazione). paesi o paesi con scarsa legislazione ambientale rtz indica che quando la corrente è importante (es. zattera di mulino, condotta forzata, diga, vagliatura) o su elementi in movimento (ruota del mulino) la dimensione dei fiocchi e dei stoppini diminuisce evolvendosi verso uno spesso biofilm incrostante, più o meno spesso , elastico e come "pergamena" . I fiocchi di Leptomitus sono fissi, ma la corrente può allentarli e lavarli via. Quindi salgono in superficie e contribuiscono alla dispersione della specie (a volte sono stati confusi con scaglie di latte cagliato o con resti di pasta di carta trasportati dalla corrente a valle di scarichi effluenti industriali). Questi fiocchi galleggianti sono di colore da biancastro a grigio-nero a seconda del contenuto di ossigeno dell'acqua in cui si sono formati e del tipo di inquinanti o residui che contengono. oppure annerirsi con i prodotti della propria fermentazione quando la parte centrale di un fiocco muore per privazione di ossigeno.
Questo numero è sconosciuto - anche approssimativamente - fino ad oggi, così come quello di tutti gli organismi fungini che nel 1991 era considerato intorno a 1,5 milioni , ma che secondo recenti stime basate sul sequenziamento ad alto rendimento sarebbe più vicino a 5,1 milioni di specie. .
Mentre nel 1998 il signor Wong aveva poco più di 600 specie (compresi circa 300 ascomiceti ) descritte scientificamente (esclusi licheni e funghi periodicamente sommersi dalla riva), 8 anni dopo (nel 2006 ) Shearer et al. contava circa 3.400 specie, sebbene fosse riconosciuto che un gran numero di specie di funghi acquatici non poteva ancora essere descritto.
E l'anno successivo (2007) Carol A. Shearer & al. aveva circa 3000 specie di funghi e 138 specie di saprolegniae trovate in habitat acquatici, la maggior parte delle quali Ascomiceti . Allo stesso tempo, Schmit ha stimato che l'ipotesi più bassa è di 8.400 specie. Alla velocità delle scoperte fatte nel 2010, ci vorrebbero più di 1.000 anni per descriverle tutte.
Meredith Blackwell, micologa dell'Università della Louisiana, ritiene che nuovi strumenti molecolari per l'inventario della biodiversità potrebbero accelerare il ritmo della scoperta. Nel contesto della crisi della biodiversità a volte indicata come la “ sesta estinzione ”, e dell'uso diffuso di fungicidi, è tuttavia probabile che alcune specie rare e/o vulnerabili siano recentemente scomparse o si trovino in una situazione critica.
I funghi acquatici sono spesso microscopici, scarsamente pigmentati o traslucidi e più fragili dei loro cugini terrestri. Sembrano meno accessibili, ma possono essere facilmente campionati in situ nell'ambiente (in acque libere o su supporti vari) o da supporti/esche immerse nell'ambiente fino a quando non vengono colonizzate da funghi, quindi recuperate e osservate in laboratorio.
Vengono poi identificati (nella quasi totalità dei casi al microscopio), successivamente in base alla loro morfologia, alla loro anatomia, alla loro sporulazione o in base ad analisi biochimiche o genetiche). Approcci come il metabarcoding potrebbero presto consentire di facilitare gli inventari in acque libere, nei sedimenti oa grande profondità.
Mentre molte specie sono chiaramente adattate alla vita sott'acqua, con propaguli dotati di capacità di dispersione acquatica altamente specializzate, e svolgono tutto il loro sviluppo e riproduzione sott'acqua, altre sono semplicemente anfibie (solo una fase del loro ciclo vitale si svolge sott'acqua, oppure questa fase è non obbligatorio). Alcuni non vivono sott'acqua, ma le loro spore possono essere disperse nell'acqua e nell'aria. Le spore di molti funghi terrestri possono essere trasportate dall'acqua cloridrica , che non conferisce a queste specie un carattere acquatico .
Pertanto, la maggior parte dei funghi costieri o trovati su ceppi o legni alla deriva sono in realtà semi-acquatici (o "aero-acquatici" ). Alcune di queste specie, che si trovano soprattutto sulle foglie, fusti o rizomi delle piante palustri, sono state classificate come acquatiche, ma si scopre gradualmente che sono spesso lo " stadio anamorfico " di vari generi di ascomiceti o basidiomiceti che si trovano sotto altre forme in l'ambiente terrestre.
Le determinanti della loro distribuzione iniziano a essere comprese meglio: sono legate in particolare al tasso di materia organica e di ossigeno, e alla temperatura, ma sono ancora oggetto di studi.
l'idromicoflora è ampiamente distribuita in tutto il mondo e si trova abbondante a quasi tutte le profondità e le altitudini (se sono presenti materia organica e ossigeno sufficienti). Alcune specie prosperano fino a una temperatura prossima a 0 °C o alcune specie estremofile tollerano altri tipi di ambiente inospitale per altre specie.
Formano solo popolazioni molto grandi e dense (a volte biofilm molto spessi e quasi monospecifici) in condizioni molto specifiche; quasi sempre legati a squilibri ecologici indotti ad esempio da gravi scarichi industriali, domestici o agricoli, o in natura dalla presenza di un cadavere di animale immerso.
Alla luce dei dati disponibili nei primi anni 2000, la diversità fungina sottomarina è massima (per tutti i gruppi noti) nella zona temperata , prima dei tropici asiatici, ma questo modello di distribuzione potrebbe essere in tutto o in parte semplicemente dovuto alla pressione. era più forte in Europa e Nord America. Molte specie devono ancora essere scoperte negli habitat acquatici, molte delle quali devono ancora essere campionate, specialmente nelle regioni boreali, Africa, Australia, Cina, Sud America e molte regioni tropicali.
Suzuki (nel 1960) stima che la distribuzione del micobiota acquatico sia globalmente uniforme nell'acqua circolante, ma che si stratifica rapidamente nell'acqua stagnante, soprattutto in estate e in inverno.
Nel 1997 , Lorenz & al. mostrano che alcuni funghi acquatici possono essere coltivati in condizioni di temperatura e pressione idrostatica corrispondenti a quelle dei fondali profondi, dove sono stati effettivamente trovati (compresi i lieviti patogeni per le modiole (bivalvi che si trovano intorno alle bocche idrotermali profonde) Una prima raccolta di funghi (filamentosi e lievito) da ecosistemi idrotermali è stato istituito nei primi anni 2000.
In acqua, invece, la ricchezza specifica dei funghi acquatici sembra generalmente diminuire con la profondità, probabilmente a causa dell'abbassamento della temperatura e del contenuto di ossigeno con la profondità. I fattori che influenzano la diversità micologica simile nel sottosuolo e nelle acque bentoniche dei laghi sono stati studiati da Silicki (2008).
Nel sedimento (superficiale o profondo)Lo studio del fungo microbico dei sedimenti marini profondi è recente. Ad oggi, sono stati trovati fino a 1.740 m sotto il fondo dell'oceano. I parametri fisico-chimici (pressione, temperatura, pH) ed ecologici ( oligotrofia più o meno importante in profondità…) sembrano strutturare queste comunità microbiche all'interno dei sedimenti marini profondi.
Recenti lavori scientifici, ad esempio di Vanessa Rédou (2011-2014) e M Navarri (2016) si sono concentrati su 183 specie di funghi, l'80% delle quali sono state isolate da campioni di sedimenti prelevati nel “Bacino di Canterbury” ( Nuova Zelanda ) tra il 4 e 1.884 metri sotto il fondale oceanico, dopo una fase preliminare di arricchimento del sedimento sotto pressione idrostatica e dopo una fase di dereplicazione. Il sequenziamento e l'analisi filogenetica hanno mostrato in questo caso una predominanza molto forte di Ascomycota (oltre l'89% dei casi). I generi Penicillium e Fusarium (noti nei continenti per essere ubiquitari) dominavano la categoria dei funghi filamentosi e il genere Meyerozyma dominava nel gruppo dei lieviti. I Basidiomycota (11%) erano per lo più lieviti Rhodotorula . Questi taxa non sono nuovi alla scienza, già conosciuti negli ecosistemi terrestri, ma qui sembrano aver sviluppato adattamenti alle condizioni estreme della biosfera profonda. Il potenziale per la sintesi di metaboliti secondari è di interesse biotecnologico. Questi ceppi sono stati "selezionati" cercando metaboliti potenzialmente bioattivi. Oltre il 96% della collezione aveva almeno uno dei geni mirati. Solo otto ceppi di lievito non presentavano nessuno dei geni desiderati.
Sorprendentemente, questi ceppi appaiono non alofili a 25 ° C. ma più la temperatura aumenta (e aumenta con la pressione nel sedimento), più resistono al sale (solo i ceppi più profondi sono realmente alofili); nel bacino di Canterbury la temperatura scende da 2°C all'interfaccia acqua-sedimento a 60-100°C ad una profondità di quasi 2 km. Il gradiente medio di temperatura nei sedimenti oceanici è di circa +25 ° C per km di sedimento.
Quasi ovunque dove la materia organica biodegradabile è presente sott'acqua sotto forma di necromassa, feci o escrementi (anche organismi viventi), sono apparse specie di funghi. Sridhar li trovò così presenti in alcuni corsi d'acqua che propose di classificarli come " planctonici " . Specie microscopiche sono state trovate nel poro ( "iporreico") l'acqua del compartimento sub-fluviali dei fiumi (quando presente e sia sufficientemente ossigenato).
Spesso distinguiamo (perché abitano specie diverse):
Alcune specie prosperano molto bene fino a circa 0 °C dove la crescita batterica è inibita dal freddo (forse in parte perché l'acqua fredda è naturalmente più ricca di ossigeno).
Alcuni microfunghi acquatici vivono in acque distrofiche e quasi anossiche , ma poi in prossimità della superficie o in acque molto correnti dove è permanentemente disponibile dell'ossigeno nell'aria (ad esempio nelle acque correnti appena a valle di alcuni scarichi di rifiuti urbani, agricoli e/o industriali generalmente).
Tuttavia, i funghi anfibi cosiddetti "superiori" hanno un importante fabbisogno di ossigeno difficilmente compatibile con una vita sott'acqua prolungata, a causa della mancanza di un adeguato organo respiratorio (si tratta di specie aerobiche divenute acquatiche). Psathyrella aquatica può sfruttare le bolle di ossigeno rilasciate da alghe, piante o spugne fotosintetiche ( Spongilla lacustris ), queste bolle possono essere temporaneamente intrappolate sotto il cappello del fungo. <nr /> Un fungo acquatico ha comunque sempre bisogno di ossigeno (in fase di crescita comunque). Questi organismi sono quindi più presenti in prossimità della superficie o in acque correnti o aerate da turbolenze costanti. In alternativa, possono anche essere trovati vicino a comunità fotosintetiche che sono una fonte diretta di ossigeno disciolto (o bolle di ossigeno che possono accumularsi sotto le branchie di Psathyrella aquatica , l'unico fungo a lame noto in grado di fare qualsiasi cosa il suo ciclo di crescita sott'acqua.
Non è noto che il micobiota acquatico dipenda dalla luce. Se la sua varietà diminuisce con la profondità, è probabilmente a causa di una ridotta disponibilità di ossigeno dall'atmosfera e dalla fotosintesi (soprattutto di notte) e un abbassamento della temperatura; due fattori ritenuti influenti anche sulla biomassa dei funghi, più della diversità micologica che sembra simile nella colonna d'acqua ea livello bentonico, ad esempio nei laghi studiati da Silicki (2008). Suzuki (1960) ha trovato una distribuzione uniforme del micobiota quando l'acqua circola naturalmente e quindi una distribuzione stratificata quando l'acqua ristagna in estate e in inverno.
De nombreuses études cherchent à préciser les conditions biotiques (trophie, variations saisonnières et interactions durables en particulier) et abiotiques (température, pH, pression, salinité, gaz et minéraux dissous dans l'eau, présence de métaux, dont le fer, etc. ) de leur développement, notamment dans les têtes de bassin versant (près des sources), mais aussi dans les lacs (A titre d'exemple, des études polonaises ont cherché à comprendre les rôles et significations des champignons aquatiques de 2 lacs présentant des caractéristiques diverse) . Micologi hanno inventariati tutti i funghi e "organismi fungiformi" lì, trovando in due anni (2005-2007) per un totale di 54 specie (tutti di tipo microrganismo, appartenenti ai generi Achlya , Anguillospora , Aphanomyces , Aplanes , Apodachlya , Composporium , Debaryomyces , Dictyuchus , Isoachlya Kluyveromyces , Leptolegnia , Metschnikowia , Pichia , Pythiogeton , Pythium , Saccharomyces , Saprolegnia , Thraustotheca , Zoophagus , l'generi Achlya e Saprolegnia essere i più numerosi in termini di specie) nella colonna d'acqua e sul fondo ( bentonici specie ) di cui 36 specie nei laghi di Marta (più poveri di ossigeno) e 45 nel lago di Sitno, con una maggiore diversità di specie dove l'acqua è più ossigenata e ricca di composti di origine biologica nelle acque superficiali. Come nella maggior parte degli altri casi, la temperatura e l'ossigeno dell'acqua sono stati qui i fattori che più influenzano la distribuzione del micobiota in queste acque lacustri. La diversità delle specie e lo Shannon Biodiversity Index erano più alti in estate. I funghi terrestri sono noti per la loro capacità (diversa a seconda della specie e del ceppo) di assorbire, bioconcentrare e sostenere alcuni metalli tossici, altri sono invece fungicidi ( rame ); tuttavia, in acqua acidificata questi metalli possono essere molto più biodisponibili.
I primi organismi acquatici di tipo fungino probabilmente si fossilizzarono male.
Si presume che i chitridi siano un gruppo molto antico. Sono la probabile base filogenetica di tutto il regno fungino, cioè probabili antenati di Zygomycota poi Ascomycota e Basidiomycota (quest'ultimo essendo quasi esclusivamente terrestre).
È probabile che a seguito di una convergenza evolutiva molte specie molto simili tra loro abbiano comunque origini molto diverse.
oltre un secolo fa, dal 1893 al 1895 de Wildeman descrisse 4 nuove specie di microscopici funghi sottomarini rinvenuti in stagni e laghetti, tutti con conidi dalla forma molto insolita. Ma le sue osservazioni suscitano poco interesse e vengono dimenticate da più di 50 anni.
Il concetto di "fungo acquatico" non fu proposto fino al 1942 dal micologo e botanico inglese CT Ingold mentre studiava funghi microscopici che degradano le foglie sommerse di ontani e salici (in un ruscello ).
Ci sono 16 specie (appartenenti a 13 generi) di cui 10 nuove per la scienza, motivo per cui a volte viene usata l'espressione "funghi ingoldi" per descriverli.
Come Wildeman prima di lui, Ingold scopre che le spore di queste specie hanno spesso una forma insolita e complessa (ramificata o lunga e curva, a volte contorta), che suggerisce potrebbe consentire loro di attaccarsi meglio alle foglie in decomposizione nei letti dei torrenti. Dai dati a sua disposizione nel 1974, stimò che "meno del 2% delle specie (di funghi) sono acquatiche" .
Vari osservatori come J. Duché nel 1945 (ingegnere EPCI, dottore in medicina, dottore in scienze) notano che da quando l'acqua è stata studiata al microscopio, sono state osservate numerose spore o funghi microscopici. Si propone di cercare di distinguere:
Osserva che il mucor thalli si forma spesso sui terreni di coltura utilizzati per analizzare l'acqua, ma non sa se in natura sarebbero in grado di vivere nell'acqua o sui sedimenti; riconosce che, fatta eccezione per i funghi parassiti di organismi prettamente acquatici, non abbiamo ancora "certi criteri per affermare che un fungo è acquatico" . Si chiede di colmare queste lacune conoscitive, perché "l'esatta conoscenza della flora micologica di fiumi, laghi e stagni, permette di fare luce su una serie di problemi di biologia lacustre o fluviale" .
Da allora sono stati fatti molti studi e, secondo Bärlocher (1982), principalmente a causa della loro vita acquatica, i funghi ingolidi hanno un'ecologia particolare.
L'ecologia della specie differisce molto a seconda che si tratti di microrganismi in sospensione o di funghi fissati temporaneamente o di lamelle (unica specie ad oggi nota), parassiti o meno.
Tutte le specie chitridi producono spore mobili (dette " zoospore ") dotate di flagello , capaci di nuotare nell'acqua o in un liquido di densità ravvicinata (sono dette uniflagellate); questo è un fatto unico nel regno dei funghi. ma si osservano altri adattamenti all'ambiente acquatico, più o meno condivisi da alcuni gruppi di specie, con punti in comune a volte notevoli, ma probabilmente spesso derivanti da una convergenza ecologica (vedi sotto).
Nota: la maggior parte dei funghi acquatici sembra utilizzare molto poco o molto raramente per la riproduzione sessuale . E il fatto di non poter osservare gli organi riproduttivi () ha reso molto difficile per lungo tempo la loro identificazione al microscopio.
Le spore idrofonge, probabilmente come quelle dei pollini delle piante sottomarine o di altri tipi di propaguli acquatici (pteridofite, briozoi, briofite, ecc.) dovevano adattarsi all'ambiente acquatico, con possibili convergenze evolutive tra queste organizzazioni.
Ad esempio, si sono evoluti per galleggiare o muoversi vicino alla superficie dell'acqua e sono spesso dioici , due caratteristiche " previste " da modelli che si concentrano sul facilitare la dispersione in acqua.
Logicamente, l' idrocoria (trasporto di propaguli che possono essere zoospore o interi talli) per corrente, spruzzi o ruscellamento) è considerata a priori la strategia di dispersione più comune nei "funghi" acquatici. Molti propaguli si osservano infatti nei corsi d' acqua , su substrati mobili, o semplicemente sospesi in acqua corrente. L'idrocoria nei fiumi comporta il trasporto unidirezionale da monte a valle. Se ciò fosse del tutto vero, l'estremità a monte di tutti i corsi d'acqua dovrebbe quindi essere molto povera di diversità specifica e genetica , o addirittura deserta da funghi acquatici e altri organismi non mobili. Tuttavia, non è così (non appena l'ambiente è ricco di materia organica sotto forma di legno, foglie o anche materia sospesa ); esistono quindi meccanismi ecologici che consentono un massiccio " sollevamento " di propaguli da valle a monte. Questa ascesa implica probabilmente la zoochory (il trasporto di propaguli da parte degli animali da un punto geografico all'altro). Tale trasporto potrebbe essere assicurato da uccelli ( ornitocoria ), pesci migratori di ritorno alle sorgenti ( ittiocoria ) e/o su distanze più brevi da altri animali acquatici che si muovono linearmente nel corso d'acqua ( Castore ad esempio ) e/o sulle sue sponde ( lontra , anfibio arvicola , topo muschiato , nutria , ecc.
Spore fungine sono state rinvenute in quantità talvolta molto elevate nel muschio che si forma in certi torrenti, torrenti e torrenti veloci oa livello delle cascate ). In India, alcune specie che si trovano in una zona a clima equatoriale sembrano tuttavia riprodursi solo in acque più fresche, in quota, perché le loro spore sono state trovate (in grande quantità) solo nel muschio dei torrenti di montagna. In questi freschi torrenti di montagna sono state rinvenute anche poche specie di tipo temperato. Ciò suggerisce che queste specie tropicali potrebbero in alcune regioni essere vulnerabili al riscaldamento globale e che il riscaldamento dell'acqua a monte e in altitudine potrebbe comportare la scomparsa di alcuni funghi saprofiti molto a valle dei fiumi. In zone umide , mari o zone alluvionali , dovute a correnti, movimenti di masse d'acqua o via zoocoria , i movimenti dei propaguli sono naturalmente più complessi. A volte possono essere enormi, veloci. Spesso sembrano molto stagionali , ad esempio durante un'alluvione).
Nel contesto della generale antropizzazione del pianeta, i canali artificiali scavati tra fiumi lontani hanno messo in relazione diretta bacini idrici che naturalmente non lo erano, così come i mari con il Canale di Suez e il Canale di Panama che ora consentono trasferimenti interoceanici diretti, compresi funghi potenzialmente patogeni o parassiti, in particolare pesci;
Allo stesso modo, la storia delle specie invasive mostra che esiste anche il trasporto di propaguli da parte di oggetti artificiali, substrati naturali colonizzati passivamente mobili, che viaggiano tra due acque o galleggianti o anche tramite oggetti attivamente mobili (scafi di barche, zavorra di navi) e può contribuire ai trasferimenti su scala da locale a transcontinentale.
Altri adattamenti alla dispersione in o sull'ambiente acquatico si trovano nelle spore non mobili dei taxa Ascomycota e Deuteromycota . Queste spore sono galleggianti e/o molto spesso hanno forme molto più complesse (soprattutto nelle specie marine) rispetto a quelle dei funghi terrestri. Queste spore sono fornite di appendici, circondate da involucri, mucillagini e/o ornamenti murali. Queste peculiarità sono state tutte interpretate come adattamenti alla dispersione e/o attaccamento a particolari substrati secondo Jones (2006).
I biologi sono rimasti sorpresi nello scoprire che i conidi di alcune specie producono abbondanti mucillagini. Ciò potrebbe svolgere un ruolo importante nell'adesione dei conidi a un substrato liscio o esposto alla corrente (Cfr. pagine 135, 137, 138, da 140 a 149 e 215, in The Ecology of Aquatic Hyphomycetes. Questa mucillagine potrebbe anche proteggere alcuni specie marine dal sale, o nelle acque vive essere un mezzo per proteggere gli enzimi secreti dai funghi mentre attaccano il substrato bersaglio, mentre senza questa mucillagine, questi enzimi sarebbero dissolti o lavati via dalla corrente d'acqua circostante.
Alcune specie (a volte patogene come Sporothrix globosa ) si trovano in quasi tutto il pianeta e la loro relativa omogeneità genetica mostra contatti e scambi genetici regolari e intensi tra le diverse popolazioni geografiche del mondo. Ciò dimostra che queste specie hanno sviluppato eccellenti capacità di dispersione ma anche adattamento a diversi ospiti e habitat.
I funghi acquatici sono eterotrofi .
La maggior parte sono saprofiti (decompositori, coprofili o lignivori e/o capaci di degradare cellulosa , chitina e cheratina o altre proteine complesse per alcune specie).
Molti di loro, grazie alle proteasi (es: cheratinasi da funghi cheratinofili e/o cheratinolitici , cioè che degradano la cheratina) che producono possono degradare chitina e cheratina in conchiglie , scaglie e tegumenti ( unghie , artigli , corna , capelli ) e pelle di organismi acquatici (o no), morti o talvolta vivi (in quest'ultimo caso sono poi detti patogeni , ma le infezioni sono spesso “ opportuniche ” (a seguito di lesioni o deplezione immunitaria per esempio).
Molte specie sono parassiti opportunisti o talvolta specialistiche o "obbligatorie", e in alcuni casi ancora poco conosciute (come nel genere di Oomycota ; la Pythiella ) o sono iperparassiti (cioè parassitizzano altri funghi parassiti).
In acqua dolce sembrano comuni associazioni simbiotiche, mutualistiche e/o commensali (della flora intestinale degli artropodi in particolare) o in altri casi associazioni parassitarie. Queste associazioni aiutano questi organismi ad accedere meglio a determinati compartimenti trofici (soprattutto materia organica sospesa, o materia organica ingerita, ad esempio per specie endofite o capaci di colonizzare parte dell'apparato digerente di un animale, che può essere l'Uomo). Le interazioni fungo-fungo o fungo-batteri svolgono un ruolo importante, anche critico, nei processi di decomposizione subacquea della materia organica, e quindi nel ciclo del carbonio , ma solo di recente sono state studiate con un approccio più olistico a questa comunità microbica. all'interno dell'ecosistema e delle reti trofiche microbiche. Queste interazioni sono complesse . Sono studiati in particolare in ambienti più o meno estremi , come nelle antiche saline del sud-est degli Stati Uniti dove, in associazione con una comunità di batteri, diverse specie di ascomiceti decompongono i resti della pianta alofila Spartina alterniflora che domina questi ambienti. In questo contesto si è riscontrato che queste comunità saprofite variano poco nello spazio o con lo stadio di decomposizione, ma molto temporalmente, a seconda di fattori ecologici ancora poco compresi, e che non possono essere spiegati dai cambiamenti di successione delle comunità o da semplici relazioni con fattori ambientali Per quanto riguarda l'abbondanza di questi decompositori, sono state invece riscontrate correlazioni negative o positive tra i taxa fungini dominanti ei batteri, che suggeriscono l'esistenza di interazioni ecologiche tra questi due tipi di decompositori.
Sono molto diversi a seconda della specie considerata. I talli dei chitridi non formano un vero micelio e alcune specie sono unicellulari .
A seconda della specie e dei tempi possono essere trovati su un substrato, all'interno o all'esterno di un altro organismo che occupano o parassitano (a volte all'interno di un altro fungo nel caso di specie iperparassitarie ) o sospesi in acqua.
Alcune specie sono note per essere animali simbionti ; ad esempio, i Neocallimastigales fanno parte del microbiota (qui attivo nel rumine ) dei ruminanti erbivori in cui contribuiscono alla degradazione della cellulosa . È probabile che esistano anche molti rapporti (simbiotici e non) con altri microfunghi, con altri microorganismi e con alghe , batteri , cianoficee e piante superiori (alcune radici acquatiche sono inguainate in un manicotto fongo-batterico che può evocare sistemi micorrize batteriologiche osservate sulla terra).
Alcuni sono patogeni di piccoli animali acquatici ( rotiferi ad esempio), di alghe unicellulari piccole come diatomee , o di organismi più grandi come piante acquatiche, invertebrati acquatici (crostacei ad esempio), pesci o ancora anfibi .
Questi ultimi normalmente se ne difendono secernendo o metabolizzando composti fungicidi o protettivi (per esempio prodotti o immagazzinati nel muco ).
I propaguli di alcune specie acquatiche si trovano spesso in ambienti terrestri, soprattutto su legni umidi e foglie.
Alcuni di questi propaguli resistono al gelo, a temperature relativamente elevate e/o ad una certa disidratazione, che permette loro di sopravvivere un tempo più o meno lungo in ambiente terrestre.
Così, sperimentando il trasferimento di dischi di foglie morte inoculati da 10 diverse specie di funghi acquatici ( ifomiceti ) su una lettiera forestale di foglie morte, al fine di testare la loro capacità di sopravvivere in "regimi idrici terrestri" , i biologi hanno osservato in 1978 che "quattro di queste specie sono scomparse rapidamente, tre dopo otto mesi, una dopo 11 mesi mentre le ultime due sono sopravvissute almeno 12 mesi" .
Uno studio canadese ha valutato (in Nuova Scozia ) la sopravvivenza in relazione alla dispersione laterale dei propaguli (perpendicolari all'asse del corso d'acqua) di ifomiceti acquatici o semi-acquatici. Gli autori hanno infatti trovato propaguli di questi funghi sulle rive e in luoghi regolarmente allagati o intorno ad essi, ma sempre meno man mano che ci si allontana dal torrente.
Sono principalmente decompositori della necromassa sommersa. In questo modo danno un contributo importante al riciclaggio della materia organica. Altri ruoli sono attribuiti ad alcune specie o a tutti i funghi acquatici:
Tutti questi funghi, e le loro spore, servono anche da cibo per molte altre specie ( zooplancton , batteri e invertebrati che li consumano). Così i Chytrids hanno almeno 5 ruoli individuati nelle dinamiche della catena alimentare:
Queste caratteristiche ci invitano a comprenderle meglio ea situare meglio il loro posto nei processi ecologici, negli ecosistemi acquatici. A poco a poco, la biologia molecolare dovrebbe consentire di valutare meglio, quantitativamente e qualitativamente, i servizi ecosistemici a cui contribuiscono, e di valutare la loro biodiversità in vari tipi di ambienti.
In acqua (come a terra) nonostante le loro dimensioni modeste e quasi invisibili, i due gruppi più importanti di decompositori microbici in termini di biodegradazione e flusso trofico sono batteri e funghi.
Agiscono insieme o in maniera complementare a seconda delle condizioni ambientali (temperatura, ossigenazione e pH in genere).
All'inizio, solo gli ipomiceti potevano essere facilmente identificati. Ma i primi studi approfonditi sulla decomposizione dei microfunghi acquatici sono stati effettuati nei primi anni 2000 grazie ai progressi della biologia molecolare. Hanno scoperto una diversità inaspettata di taxa ( Ascomycota , Basidiomycota , Chytridiomycota , Zygomycota e Oomycota ).
Biodegradazione di foglie e piante non lignificatePer quanto riguarda la lettiera e non legnose residui vegetali (che si depositano rapidamente al fondo dell'acqua, soprattutto in autunno nel freddo e climi continentali o quasi tutto l'anno nella zona equatoriale), abbiamo nel 1990 al 2000 ha chiaramente dimostrato che la le foglie morte depositate nell'acqua sono piuttosto degradate dai funghi quando l'acqua è ben ossigenata (torrenti, fiumi veloci), e piuttosto dai batteri in condizioni più anossiche (stagni, paludi). Nelle acque torrenziali, i funghi sono ulteriormente aiutati dalla degradazione meccanica del legno e delle foglie.
Nel 1996 , K Suberkropp e H Weyers ( Università dell'Alabama ) hanno scoperto che "la produzione di batteri e funghi aumenta esponenzialmente con l'aumento della temperatura" . Inoltre, nelle acque correnti studiate da questi due autori, "su foglie colonizzate per 21 giorni la produzione di carbonio fungina era da 11 a 26 volte maggiore della produzione di carbonio batterica" mentre sul fondo di una palude i batteri predominano ampiamente durante tutto l'anno (da 10 a 18 volte più attivo in una palude costiera di acqua dolce studiata da N Buesing e M. O Gessner nel 2006).
Rispetto ai loro omologhi terrestri, i funghi che biodegradano le foglie morte in torrenti e fiumi veloci hanno sviluppato adattamenti che, ad esempio, li rendono meno visibili ai loro predatori (spesso conidi trasparenti) o consentono ai loro propaguli di "trovare" meglio il loro bersaglio e che vi aderiscono meglio (Brown, autore della teoria del moto browniano, era stato incuriosito dal fatto che le spore ei granelli di polline presenti nell'acqua non si muovessero in modo casuale. ).
Altri adattamenti consentono anche a determinati propaguli di "attaccarsi" efficacemente (ad esempio alla superficie di un ramo o di una foglia morta) nonostante una forte corrente.
Diversi autori hanno recentemente dimostrato o confermato che diversi tipi di foglie sono colonizzate da diversi tipi di funghi, e che su alcune foglie (foglie di quercia per esempio) una delle facce (parte inferiore) in questo caso era molto più facilmente colonizzata dai conidi. presente nel mezzo. Inoltre, i nutrienti e gli oligoelementi vitali per i funghi devono essere presenti in modo sufficiente affinché il metabolismo dei funghi sia il più efficiente; la chimica dell'acqua è di grande importanza per i funghi acquatici, che non riescono a trovare certi elementi nei suoli con la stessa facilità con cui le loro controparti terrestri. Così come il livello di ossigeno che può non essere un fattore determinante per la crescita di alcuni funghi, rimanendo tale per la loro sporulazione. Nel contesto dell'eutrofizzazione e dell'anossia (fenomeno di acqua morta ipossica ) i batteri generalmente prendono il sopravvento.
Biodegradazione del legno mortoL'interno di un pezzo di legno morto sommerso è povero di ossigeno, soprattutto se il legno è denso. In acqua questo rende molto più difficile la colonizzazione dei funghi che se lo stesso legno morto fosse solo umido ed esposto all'aria.
Inoltre, l'area immediatamente accessibile ai funghi è molto più ampia sulle foglie morte sommerse che sul legno morto.
Da tempo mancano dati quantitativi sulle rispettive decomposizioni di foglie e legno da parte dei funghi, tuttavia, la produzione fungina può ora essere valutata (secondo un metodo sviluppato per i funghi del suolo) misurando i livelli d. incorporazione di acetato radiomarcato a 14 carbonio ( 14C-acetato) in ergosterolo .
Nel 2008, uno studio si è concentrato su due corsi d'acqua negli Appalachi meridionali (uno che funge da riferimento e l'altro è arricchito con sostanze nutritive). Questo lavoro, condotto dalla Coastal Carolina University, ha valutato in parte il ruolo dei funghi acquatici su un ciclo annuale di decomposizione del legno morto, cercando inoltre di confrontare l'efficienza di decomposizione di piccoli legni morti (<40 mm di diametro, raccolti a caso) con quella del decadimento fungino di foglie morte. Proprio come la respirazione microbica sul legno (per grammo di carbonio detritico), è stato dimostrato che l'attività fungina è molto inferiore (di un ordine di grandezza) rispetto a quella misurata sulle foglie. Gli autori hanno inoltre scoperto che l'attività microbica (per grammo di carbonio) era significativamente più alta nel flusso arricchito di nutrienti. Tuttavia, come ingresso di legno annuale del corso d'acqua sia in termini di input carbonio in questi casi da due a tre volte maggiore di carbonio in entrata dovuta solo a foglie morte, la quota di ingresso del materiale organico ottenuto direttamente da legno da funghi è definitiva paragonabile in questo ambiente a quello ottenuto dalle foglie morte (15,4% per il legno e 11,3% per le foglie nella corrente di riferimento; e 20,0% per il legno e 20,2% per le foglie nella corrente arricchita di nutrienti. Gli autori concludono che nonostante una attività fungina media (circa 5 volte inferiore per grammo di carbonio detritico considerato) sul legno rispetto alle foglie, i funghi possono quindi essere altrettanto importanti per il legno quanto lo sono per le foglie nel riciclaggio del carbonio dalle foglie e dal legno morto nei corsi d'acqua.
Queste specie erano anticamente classificate con le piante , sulla base di criteri morfologici che lo stesso Ingold capì ben presto che derivano da convergenze evolutive (la forma delle spore in particolare potrebbe essere secondo lui 3 risposte alle naturali pressioni selettive identicamente sviluppate da filogeneticamente distanti specie:
La maggior parte delle specie sono state trascurate dalle scienze sperimentali a quasi ogni fine del XX ° secolo.
Oggi non esiste una classificazione specifica per i funghi acquatici, perché i dati biomolecolari disponibili mostrano che essi non costituiscono di per sé un gruppo tassonomico, ma che questo "gruppo" ha origini multiple all'interno dell'albero della vita ; alcuni di questi organismi sono più vicini agli animali e un'altra parte più vicina alle piante primitive.
Inoltre, la tassonomia generale dei funghi è ancora soggetta a modifiche. Per ragioni pratiche e scientifiche, questi taxa sono oggi raggruppati all'interno del regno dei Fungi e del sottoregno Dikarya (Hibbett et al. 2007) ma la loro variabilità morfologica e genetica, nonché la somiglianza che esiste tra molte specie comportano un lungo lavoro di studi genetici e biochimici al fine di stabilizzare la loro classificazione.
Questo lavoro è iniziato in tutto il mondo, ad esempio per Blastocladiales , Monoblepharidales , Saprolegniales , Leptomitales e Legenidiales , ma molte specie (forse dal 50 al 75% di quelle realmente esistenti secondo una stima fatta nel 2011 da Meredith Blackwell) hanno probabilmente non ancora scoperti, o sono ancora confusi con altri o falsamente identificati.
Così, alcune specie, appartenenti in particolare al gruppo dei Chytridiomycota (o ' chytrides o Chytridiomycetes ); una delle quattro grandi divisioni del regno fungino) può avere un ciclo acquatico. Il gruppo chitride che riunisce la maggior parte di questi funghi acquatici è stato suddiviso in cinque ordini.
Nel 1998, Michelle KM Wong (Università di Hong Kong) ha distinto in modo informale 3 gruppi:
Forse a causa della diversa disponibilità di ossigeno, i funghi tipici degli habitat lentici generalmente differiscono da quelli che vivono negli ambienti lotici. Alcuni dei funghi che si trovano a valle in acque lente e calde si riproducono solo a monte in acque più vivaci e fresche.
Le specie fungine sottomarine (in particolare unicellulari) costituiscono una parte ancora poco esplorata del patrimonio naturale , soprattutto nelle aree tropicali, ma non esclusivamente.
A titolo di esempio:
Stiamo iniziando a essere in grado di studiare meglio alcune specie rare padroneggiando meglio la loro cultura ex situ . e grazie a nuovi mezzi di analisi genetica e biochimica.
I tassonomisti osservano che alcune specie si sovrappongono tra i taxa terrestri e quelli d'acqua dolce, ma questo fenomeno è raro tra i taxa d'acqua dolce e quelli marini.
Verso la metà del XX ° secolo, nel cercare, è stato trovato dentro, sopra le alghe , il legno e archi nella zona intertidale e sotto il livello delle acque a basso contenuto di Aberystwyth e alcuni siti sulla costa della Baia di Cardigan ( Irlanda del Nord ) , nel 1951 furono osservate venti specie di Pyrenomycetes e funghi imperfetti (17 già descritte e 3 probabilmente nuove specie; diverse non erano mai state citate per la Gran Bretagna ; Halophiobolus salinus , H. opacus , Ceriosporopsis halima , Peritrichospora integra , Remispora maritima , Amphisphaeria maritima , Helicoma maritimum , H. Salinum , Speira pelagica e marina Botryophialophora . .
Nel 2010 sono state descritte solo 537 specie di funghi esclusivamente marini, ma il numero effettivo di taxa potrebbe superare le 10.000 secondo EG Jones, un numero che rimane molto basso per la scala planetaria, rispetto ai taxa terrestri. Inizialmente si pensava che esistessero poche specie marine ( soprattutto Dikarya ) e localizzate principalmente vicino alle coste, ma il sequenziamento ad alto rendimento ha rivelato nuovi filotipi e lignaggi sconosciuti. Lo studio del DNA ambientale non ha rivelato una biodiversità molto elevata.
Nel 2019 , mentre la ricerca sta preparando nuove strade e strumenti nel campo, questi funghi marini rimangono molto poco conosciuti. Sappiamo che la loro biomassa è importante a livello locale, la loro tassonomia non è stabilizzata e alcuni micologi specializzati in questo campo stanno cercando di sapere se hanno gli stessi ruoli in mare o ruoli simili a quelli che hanno negli ecosistemi terrestri o in acqua dolce.
Si trova sui detriti di piante morte, e altri galleggianti o filamento substrati organici, ed in aree esposte a spruzzo ( spiagge , dune , come lignicolous specie di legni per esempio, ma anche sotto forma di spore vivono all'interno sabbia (ad esempio marino Ascomiceti e funghi imperfetti ) Molte specie probabilmente non sono state ancora descritte o studiate, specialmente nei tropici, e per i taxa endofiti e criptici
Alcuni sono funghi coprofili e crescono sugli escrementi di uccelli acquatici o feci di altri animali acquatici. Nei laghi , alcune specie microscopiche crescono sui cadaveri di crostacei o organismi planctonici. Le specie marine costiere potrebbero essersi discostate all'inizio dell'albero della vita.
Microfunghi si trovano anche nei laghi salati, ad esempio due specie ( Monodktys pelagica (Johnson) Jones e Naïs inornata Kohlm) rinvenute nei primi anni '70, per la prima volta fuori dal mare, in un lago del Wyoming ricco di MgSO4 e crescita di Na2SO4
i funghi terrestri o acquatici, e anche i marinai, e la riproduzione (sporulazione) sono colpiti oltre una certa salinità (a seconda della specie). Tuttavia, alcuni ascomiceti marini sono molto tolleranti alle condizioni di salinità (alta o bassa) mentre i loro cugini Ascomiceti d'acqua dolce non possono tollerare l'acqua salata. I funghi imperfetti sembrano piuttosto tolleranti. Gli ipomiceti non sopportano acque molto dolci (oligotrofiche debolmente mineralizzate). Nel Chaetomium globosum il sale agisce solo in alcuni punti del suo ciclo di sviluppo.
È poco valutato e probabilmente varia a seconda della specie, dei ceppi e del patrimonio immunitario e della vulnerabilità delle specie attaccate da questi funghi. A titolo di esempio, generi Saprolegnia , Aphanomyces e Achlya sono molto infettive per crostacei , anfibi , molluschi e pesci . Negli allevamenti ittici, alcuni funghi di questa famiglia si insediano sulle uova morte e da lì contaminano le uova vive;
È ancora poco studiato, ma - come i loro cugini terrestri - i funghi marini studiati si dimostrano in grado di assorbire e bioaccumulare determinati metalli pesanti o oligoelementi metallici .
Mentre le foglie di canneti ( Phragmites australis ) hanno dimostrato di decomporre sott'acqua, il livello di oligoelementi metallici e metalli pesanti (tratto da acqua) aumenti di decomposizione organica materia alla stessa velocità. Che il livello di dell'ergosterolo (che indica colonizzazione di questo nuovo substrato da parte di funghi acquatici), interferendo anche con il ciclo degli inquinanti metallici nelle aree umide;
Questo vale per l'ambiente marino. Così due specie marine ( Corollospora lacera & Monodictys pelagica ) assorbono piombo in dosi elevate senza effetti tossici per loro, e bioaccumulano cadmio che però - a differenza del piombo - ne inibisce gravemente la crescita; soprattutto per M. pelagica e quindi in questo caso che il livello di ergosterolo diminuisce all'aumentare della concentrazione di cadmio del fungo. Questi due metalli vengono assorbiti dal micelio che cresce su un substrato che li contiene (in forma bioassimilabile), tanto più che il contenuto di metallo è elevato. È emerso che il micelio di C. lacera disintossica il piombo che assorbe immagazzinandolo (per il 93% di tutto il piombo assorbito) nello spazio extracellulare del fungo. M. pelagica ha dimostrato di essere in grado di bioconcentrare più di 60 mg di cadmio e più di 6 mg di piombo per grammo di micelio, mentre C. lacera bioaccumula più di 7 mg di cadmio e fino a 250 mg di piombo per grammo di micelio. In entrambi i casi i metalli bioaccumulati possono contaminare organismi acquatici micofagi (lumache acquatiche, alcuni pesci che si nutrono raschiando il biofilm presente su vari substrati) e poi la rete trofica.
La maggior parte delle specie di funghi acquatici sono microscopiche, traslucide e difficili da identificare; e probabilmente non sono stati ancora inventariati o scoperti. Lo stato delle popolazioni può quindi essere valutato solo approssimativamente , e non abbiamo uno stato zero che ci permetta di sapere se queste popolazioni sono state stabili o in declino per un secolo o più.
Diversi tipi di fungicidi sono ampiamente utilizzati in tutto il mondo e distribuiti in natura. Alcuni di essi finiscono nei laghi, nei fiumi e nel mare (soprattutto quelli che sono i più solubili in acqua e quelli che si attaccano alle particelle del suolo che possono essere trasportate dall'acqua.' erosione . il meccanismo ecotossico fungicida varia principalmente a seconda dal tipo di molecole che contiene e dalla dose. in generale, i fungicidi sono una minaccia diretta e crescente per le "specie non bersaglio" che non sono correttamente prese in considerazione dagli studi di valutazione ecotossicologica di questi biocidi, poiché sono sempre più utilizzati intorno al mondo e si trovano spesso nei fiumi e nelle zone umide a seguito di deflusso o "deriva aerea" d' aerosol .
Gli effetti di questi biocidi sui funghi acquatici possono, come per altri organismi, essere testati tramite test individuali in vitro e/o in microcosmi ; spesso variano molto in base alla dose ma anche in base alla loro sensibilità o al loro stadio di sviluppo, oppure a seconda che l'esposizione sia breve o cronica della specie considerata.
Poco lavoro è stato fatto sui gruppi fungini acquatici, ma fenomeni di selezione adattativa con comparsa di ceppi patogeni resistenti ai fungicidi sono già stati osservati nel caso della terapia antibiotica o dell'uso agricolo di fungicidi (ad esempio con micosi (es.: Aspergilliosi o Candidosi ) antibiotico-resistenti e altre antibiotico-resistenza in medicina umana o veterinaria o con comparsa di resistenza a fungicidi quali benzimidazoli e tiofanati nei cereali o nel caso di trattamenti contro l' oidio nel frumento e altri biocidi in genere in altri microrganismi in grado di riprodursi in gran numero e rapidamente.Al contrario, alcuni effetti possono essere facilmente sottovalutati: Così, a volte, anche se il fungo non sembra essere influenzato nella sua crescita o attività, basse dosi di biocida possono inibire la sua sporulazione e/o la germinazione dei conidi (da cui la germinazione di Campylospo conidispo ra chaetocladia, Flabellospora verticillata, Flagellospora penicilliodes, Helicosporium sp., Lunulospora curvula e Wiesneriomyces javanicus non è inibito in laboratorio fino a 1 mg 1 (-1) per diversi pesticidi testati, ma oltre questa concentrazione, il tasso di germinazione dei conidi è diminuito all'aumentare della dose. Per ragioni ancora poco comprese, secondo Chandrashekar & al. (1994), “la tolleranza degli organismi alle sostanze chimiche può essere considerata correlata al substrato” . Al di sopra di questa concentrazione la germinazione dei conidi percentuali diminuiva con l'aumentare della concentrazione.
Nonostante alcuni progressi metodologici e tecnici per la valutazione ecotossicologica dei fungicidi, essendo gli studi sugli effetti incompleti, gli effetti tossici dei fungicidi e di altri biocidi sulla comunità fungina acquatica avrebbero potuto essere sottovalutati. Uno studio olandese (2011) ha cercato di scoprire se le soglie autorizzate o considerate accettabili per la salute umana o per la protezione dei produttori primari e di vari vertebrati (pesci, crostacei, mammiferi, ecc.) siano in grado di proteggere anche i “funghi acquatici selvatici”. E non obiettivi. Sulla base di test di ecotossicità effettuati su un panel di diverse specie fungine e Oomiceti isolati e individuati in acque superficiali inquinate nei Paesi Bassi (per sette fungicidi con modalità d'azione differenti) si sono effettivamente osservati effetti ecotossici acuti, a dosi inferiori a quelle i regolamenti consentono 3 tipi di fungicidi ( triazolo , epossiconazolo e tebuconazolo ). Tuttavia, negli ambienti agricoli e antropizzati contemporanei, questi funghi possono essere esposti a "cocktail" di molti fungicidi e talvolta "cronicamente" , con effetto cocktail ( sinergico ) ed effetti diretti o indiretti e ritardati nello spazio e/o nel tempo.
Molti funghi acquatici sono vulnerabili a basse dosi (da 5 a 10 mg/l) di fungicidi, ad esempio le dosi comunemente utilizzate tra cui la poltiglia bordolese .
Essi sono anche sensibili a certi insetticidi come il BHC ( esaclorobenzene ), e naturalmente a vernici antivegetative, anti licheni prodotti utilizzati per i tetti o edifici o anche antifoolings specificamente utilizzati per scafi di navi protette pulizia. (Sridhar e kaveriappa 1986).
Alcune specie, che necessitano di acqua dolce e ossigenata per riprodursi, potrebbero essere vulnerabili al riscaldamento globale .
A livello locale e talvolta su vaste aree, colture irrigue (con fungicidi) e drenaggio agricolo delle zone umide (che in Francia è stato esacerbato negli anni '70 dal consolidamento di vasti terreni e da nuove tecniche di drenaggio ed evacuazione dell'acqua), il riempimento o l'intasamento di stagni o l'eccessivo sfruttamento di le risorse idriche superficiali potrebbero o causeranno il declino delle popolazioni di funghi acquatici.
Queste specie svolgono un ruolo importante nel ciclo del carbonio e nell'autodepurazione dei corpi idrici.
Hanno un forte potenziale medico (i primi antibiotici sono stati derivati da funghi).
Esistono anche questioni industriali, oltre che in termini di biomimetica .
Queste specie hanno un valore di bioindicatore . Di questioni di valutazione ambientale e sanitaria quindi esistono anche. Ad esempio, alcuni sono molto sensibili al livello di ossigeno, ai fungicidi o all'acidificazione (nella colonna d'acqua in ambienti "normali" o " estremofili " e alla temperatura, nonché al contenuto di acqua. materia organica nell'acqua, tre parametri fortemente influenzati dall'uomo in aree antropizzate (sempre più vaste) e nell'ambito del cambiamento climatico e dell'acidificazione delle acque (precipitazioni e altri ambienti acquatici, anche attraverso il drenaggio acido delle miniere ), inoltre alcune specie sono patogene o parassitarie (responsabili di funghi infezioni e ulcere dei pesci, delle tartarughe, della peste dei gamberi , della massiccia mortalità degli anfibi...), e quindi sono di interesse per l' agricoltura, la zootecnia, anche per la
salute umana.
Queste specie dovrebbero essere prese in considerazione quando si misura il buono stato ecologico di acque e bacini, poiché tra i funghi acquatici troviamo sia bioindicatori, sia alcune specie patogeni e/o sus rischia di avere un impatto molto negativo sulla biodiversità (soprattutto anfibi) in una situazione di squilibrio ecologico. Un'altra sfida è trovare strategie per il biocontrollo di questi funghi quando sono patogeni fastidiosi per l'uomo, le colture, l'acquacoltura e altre forme di allevamento, ovvero il controllo biologico in campo medico, veterinario e agroindustriale (protezione del legno), pur limitando l'uso di biocidi tossici e talvolta non biodegradabili , come nel caso degli antivegetativi o di alcuni prodotti per la protezione del legno.
Al contrario, alcuni funghi possono essere utilizzati come " biopesticidi " contro determinati parassiti delle colture, o contro determinati vettori di malattie, garantendo che non rischino di intaccare gli ecosistemi o di diventare invasivi (se utilizzati fuori contesto biogeografico naturale).
Fu solo nel XX ° secolo la realizzazione che i funghi acquatici avevano anche riproduzione sessuale, incontrano anche le leggi darwiniane genetica e selezione come funghi terrestri, sono piante molto differenti. Tre scienziati Burgeff, Kniep e Lindegren hanno aiutato ad avviare gli studi genetici micologici. la ricerca in micologia ha trovato rinnovato interesse con la scoperta della penicilina, poi ancora con lo sviluppo delle biotecnologie ed in particolare della biologia molecolare .
Come decompositori subacquei, alcuni di questi funghi (o la loro conoscenza approfondita) potrebbero forse fornire soluzioni per migliorare l'efficienza degli impianti di trattamento delle acque reflue, la produzione di agrocarburanti o biocarburanti o altri prodotti biobased utili, in particolare da materiali organici e agroalimentari e industriali rifiuti oggi difficili da sfruttare a causa, ad esempio, di un alto contenuto di lignina o cellulosa. Lo stesso vale per il campo della filtrazione, bonifica o biorilevazione di alcuni inquinanti dispersi, ma ponendo problemi a basse dosi.