Tassonomia
La tassonomia o tassonomia è una branca della scienza naturale (ribattezzato biologia al XX ° secolo), che mira a descrivere la diversità degli organismi viventi e di raggrupparli in entità chiamate taxa di identificare (anche attraverso chiavi di identificazione ), descriverli , nome li e li classificano .
Costituisce un sotto-ramo della sistematica che mira, prima di tutto, a enumerare e definire i legami di parentela tra i diversi organismi viventi , ea classificarli in categorie gerarchiche (es. Generi, famiglie, ordini). Queste due discipline sono così strettamente collegate che la differenza tra tassonomia e sistematica non è sempre evidente.
La tassonomia contemporaneo, evolutivo, sulla base di un approccio fondamentalmente filogenetico di classificazione ma tassonomie analisi empirica è rimasta a lungo sconosciuta alla scienza prima dell'arrivo, durante la seconda metà del XX ° secolo, le scoperte della biologia molecolare .
Per estensione, il termine tassonomia viene ora utilizzato in altre scienze, come le scienze umane e sociali , dell'informazione scienze o informatica scienza .
La parola tassonomia deriva dal greco τάξις ( taxi ) "posizionamento", "classificazione", "ordine" e da νομός ( nomos ) che significa "legge", "regola"). Il termine fu creato nel 1813 , con l'ortografia di tassonomia , dal botanico svizzero Augustin Pyrame de Candolle (1778-1841) nella sua Teoria elementare della botanica o esposizione dei principi della classificazione naturale e dell'arte di descrivere e studiare le piante , per designare nella sua "teoria delle classificazioni" sia il metodo che ciò che qualificava come "basi di botanica filosofica" ( Mémoires et souvenirs , Libro III, § 11). Nella seconda edizione pubblicata nel 1819, considerava l'ortografia della parola tassonomia errata nella sua forma originale, affermando: “Sarebbe più corretto dire tassonomia; ma ho pensato di dover ammettere la cancellazione della e , per abbreviare la parola. " . Ciò dimostra che De Candolle in realtà derivò il suo termine tassonomia , non dal nominativo τάξις ( taxi ) ma dal suo genitivo τάξεως ( taxôs ).
Il termine tassonomia fu ratificato nel 1836 nel Supplemento al Dizionario dell'Accademia di Francia .
L'ortografia tassonomica fu raccomandata nel 1864. Émile Littré , nel suo Dizionario della lingua francese (versione 1872-1877) specificava che poteva essere usata anche la parola tassonomia o tassionomia , formata sull'etimo greco taxi (ordine). Il Grand Dictionnaire Terminologique , in Quebec , conferma che la tassonomia è raccomandata da diversi autori considerando la "tassonomia" come "una traccia della tassonomia inglese ", che è però storicamente falsa. In effetti, la tassonomia non apparve in inglese fino al 1819 sotto l'influenza dei francesi, sei anni dopo essere stata inventata da De Candolle. Tuttavia, i dizionari francesi continuano a diffondere l'errore che l'ortografia della tassonomia (De Candolle, 1813) corrisponda alla tassonomia inglese . Al contrario, la maggior parte dei dizionari inglesi afferma correttamente che la parola tassonomia deriva dal francese e, per TLFI , la tassonomia inglese apparve solo nel 1828 nel dizionario americano Webster .
Il termine tassonomia non deriva dalla parola taxon, essendo quest'ultima un concetto apparso in seguito (una parola creata dal botanico Herman Johannes Lam nel 1948 ). Quindi, la tassonomia non è, etimologicamente, lo studio dei taxa ma le leggi dell'ordine, quindi le regole della classificazione . Alcuni specialisti fanno la differenza nell'uso, in particolare in botanica , tra la tassonomia che, formata sull'etimo greco nómos (legge, regola), riguarda questioni di classificazione, e la tassonomia che, formata sull'etimo greco ónoma (nome), si riferisce a questioni di nomenclatura . Altri scienziati usano il termine tassionomia nel loro lavoro, in particolare in zoologia , per nominare gruppi di esseri viventi. Tuttavia, la parola tassonomia è anche e molto spesso usata per nominare la scienza della descrizione dei taxa. Anche gli autori che sostengono l'uso del termine “tassonomia” non parlano di “taxini” ma di taxa, con l'eccezione, però, di uno specialista in entomologia che invoca la diffusione della conoscenza francofona e deplora l'influenza dell'inglese. Altre lingue usano termini simili a "tassonomia", non "tassonomia"; Quindi, scriviamo Tassonomia in tedesco, tassonomia in inglese, tassonomia in spagnolo (castigliano), tassonomia in portoghese e catalano, tassonomia in italiano, таксономия ( taksonomiya ) in russo, ecc.
Nel 1957, in Francia, l' Accademia delle Scienze ha adottato il nome "Tassonomia" per designare la scienza della classificazione.
Il termine è diventato una pratica comune nel XXI ° secolo, sia nella sceneggiatura originale, tassonomia, anche se è etimologicamente sfidato o considerato sbagliato, o sotto l'ortografia corretta da Émile Littré , tassonomia con una "i", anche se quello è consapevolmente confutata. La sostituzione della "o" con una "i" è percepita da alcuni come purismo , che preferiscono il termine "tassonomia", affermando un uso maggioritario, coerenza e un "principio di priorità".
La parola “tassonomia” è usata nelle appendici del Codice internazionale bilingue di nomenclatura zoologica (pubblicato in francese e inglese ) nel 1961 per la prima edizione e nel 1964 per la seconda edizione.
Il testo francese della terza edizione del Code international de nomenclature zoologique (1985) menziona il termine "tassonomia". Nel glossario , la "tassonomia" è definita come "La teoria e la pratica della classificazione degli organismi; parte della sistematica, lo studio delle categorie di organismi e della loro diversità ”.
Il testo francese della quarta edizione del Codice internazionale di nomenclatura zoologica (1999) menziona i due termini "tassonomia" e "tassonomia". Nel glossario, "tassonomia o tassonomia" è definita come "Teoria e pratica della classificazione degli organismi".
In biologia, la tassonomia è inseparabile dalla sistematica . Quest'ultimo essendo definito come lo studio della diversità e delle relazioni evolutive tra organismi viventi o fossili, comprende naturalmente due componenti complementari che sono la filogenetica , cioè la disciplina interessata alla ricostruzione dell'albero della vita , e la tassonomia che produce classificazioni formali. Il modo in cui la tassonomia deve tenere conto dei risultati della filogenetica è anche fonte di vivaci controversie metodologiche e soprattutto filosofiche.
In pratica, il termine “sistematico” designa sia il metodo utilizzato (diciamo ad esempio il “sistematico filogenetico”) sia il risultato ottenuto con questo metodo (la “sistematica degli Agaricales ”). Nel senso concreto del risultato, le due scienze non sono molto distinte e spesso confuse, perché praticate contemporaneamente dalle stesse persone. I tassonomisti sono sempre stati chiamati sistematici, perché dopo aver studiato e descritto gli organismi, hanno cercato abbastanza naturalmente di classificarli dal basso livello di specie ( tassonomia alfa o "tassonomia primaria").
Coloro che utilizzano principalmente il senso del metodo ( filogenetisti in particolare) spesso chiamano il risultato "classificazione", o talvolta "tassonomia" per abuso di linguaggio, soprattutto nelle discipline non biologiche (vedi Tassonomia (disambiguazione) ).
La prima classificazione delle piante è generalmente attribuita a Teofrasto alla fine del IV ° secolo aC. D.C. , anche se la sua Storia delle piante riprende in parte le teorie della Scuola Pitagorica . Il primo classificatore noto di animali fu Aristotele , nel trattato Storia degli animali . Quello che viene tradizionalmente presentato come il "padre della scienza", prende in prestito la distinzione da Democrito dividendo gli animali in due classi, quelle che hanno sangue e quelle che non lo hanno (animali con sangue bianco o incolore che chiama linfa). Si suddivide animali rosso di sangue in cinque classi (quadrupedi vivipari, cetacei, uccelli, quadrupedi ovipari, e pesce) e gli animali a sangue bianche in quattro (molluschi, testacei , crostacei e insetti).
Il naturalista svedese Linneo ( 1707 - 1778 ) ha posto le basi di sistematica , ed è stato autore di una classificazione i cui principi fondamentali sono stati la base per la sistematica scientifica fino alla metà del XX ° secolo .
Anche se, come il metodo di Jussieu , utilizza nomi binomiali e sostiene il "metodo naturale" opposto al "sistema artificiale" di Carl von Linné , la tassonomia proposta da de Candolle se ne discosta per l'importanza data ai tagli. Mentre per Linné e Jussieu la natura " non fa un salto ", Candolle insiste sulle discontinuità che sono alla base della nozione di taxon , entità e taglio .
Nella sistematica classica (a volte chiamata "Linneo"), l'ordine gerarchico interno dei taxa era originariamente basato su criteri di somiglianza "morfologica" e presunte affinità. Anche se fortemente antropocentrica e riflettere le cause della diversità degli esseri viventi ( la creazione di Dio ), come abbiamo pensato che i seguenti 250 anni, è ancora agli inizi del XXI ° secolo , parte del bagaglio culturale comune di tutti i naturalisti. Ma successivamente, con il progredire della conoscenza, in particolare dal lavoro di Jean-Baptiste de Lamarck e Charles Darwin , questo ordine ha avuto rapidamente l'ambizione di fornire inoltre un'immagine dell'evoluzione .
L'antropocentrismo fu sconfitto con Charles Darwin che raccomandò il 24 novembre 1859 (in The Origin of Species ) una classificazione puramente genealogica . Se c'è stata evoluzione, le specie dovrebbero essere classificate in base al loro grado di correlazione evolutiva . Ma ci vorrà quasi un secolo prima che l'eliminazione dei taxa polifiletici diventi consensuale. D'altra parte, interpretazioni divergenti del termine "genealogico" in Darwin, come distanza patristica o come attualità relativa dell'ultimo antenato comune , hanno dato origine a due correnti intellettuali opposte nella tassonomia, rispettivamente evoluzionismo e cladismo .
Nella seconda metà del XX ° secolo , la cosiddetta sistematica filogenetica cresciuto da un metodo di ricostruzione, che è stato uno sviluppo tormentone: la cladistica iniziato da Willi Hennig nel 1950 . Questo metodo si basa globalmente su relazioni evolutive per le quali il criterio fondamentale per la scelta della classificazione è che deve rispecchiare rigorosamente la filogenesi, cioè i gradi di parentela tra le specie. La nozione stessa di tale filogenesi è una conseguenza della teoria dell'evoluzione e il successo predittivo degli alberi filogenetici è una delle prove di questa teoria.
Importanti progressi nella genomica sono stati resi possibili dall'analisi genetica automatica e dallo sviluppo di strumenti e modelli informatici. Impongono e consentono la ridefinizione di determinate specie o gruppi di specie e consentirebbero una migliore conoscenza e monitoraggio delle specie.
Tutte le classificazioni attuali hanno la forma di un albero (classificazione arborescente), da una radice che include tutti gli esseri viventi che esistono o sono esistiti, agli individui . Ogni nodo dell'albero definisce un taxon , che raggruppa tutti i sub-taxa generati dal nodo.
Un concetto di classificazione importante e abbastanza stabile è quello di specie . Questo raggruppamento è relativamente ben definito, almeno per le specie riproduttive .
La specie è definita come una comunità di esseri viventi interfertili (o interfertili , capaci di riprodursi tra loro), in grado di scambiare materiale genetico e produrre discendenti essi stessi fertili (infatti, alcuni individui dello stesso genere ma appartenenti a specie diverse possono incrociarsi dare un individuo ibrido , ma questo è molto spesso sterile). Nel caso della moltiplicazione strettamente asessuata , si parla impropriamente di specie invece che di lignaggio , essendo il gruppo puramente filogenetico. Il caso delle entità che confinano con i viventi ( virus , prioni ) è ancora diverso; sono generalmente esclusi dalle classificazioni. Un'altra difficoltà da citare è quella delle simbiosi strette, come i licheni (che uniscono un organismo di natura fungina, e un organismo capace di fotosintesi, di natura vegetale), ma in generale, uno dei due partner è in grado di vivere senza s ' associarsi all'altra, e possiamo classificarle in due specie distinte, con la caratteristica di una delle due specie di non poter sopravvivere senza l'altra.
La descrizione di una nuova specie viene effettuata da un tassonomista sulla base delle attuali conoscenze, sulla base dei dati disponibili e degli strumenti di analisi. Questa descrizione può essere messa in discussione da un altro specialista che non condivide la stessa concezione, o dalla scoperta di nuovi metodi di analisi.
Le specie sono denominati in base al sistema binomiale utilizzato per la prima volta da Guillaume Rondelet e Pierre Belon nel XVI ° secolo e generalizzata da Carlo Linneo nel XVIII ° secolo . Il nome scientifico di una specie è la combinazione di due parole latine o considerate latine (fino a tre in alcune discipline, per una sottospecie, varietà o forma) solitamente scritte in corsivo : un nome del genere, seguito da uno o due epiteti specifici.
Sotto il rango del genere, tutti i nomi dei taxa sono chiamati combinazioni. Esistono diverse categorie di combinazioni:
L' attuale approccio filogenetico utilizza i dati della cladistica , ma i suoi requisiti sono limitati ad accettare solo taxa monofiletici , cioè corrispondenti a un dato clade . Chiede che i taxa siano limitati a quelli che soddisfano le seguenti due condizioni:
Si parla quindi solo di taxon monofiletico o clade. Questo vincolo ha determinato cambiamenti fondamentali nella classificazione scientifica, alcuni dei quali hanno ribaltato il "buon senso" modellato dal patrimonio culturale. Così, i dinosauri non sono scomparsi , la sistematica moderna include gli uccelli nel raggruppamento "dinosauri".
Tra gli altri esempi, taxa tradizionali come rettili , pesci , alghe , dicotiledoni , pongidi , non hanno il diritto di essere citati nella sistematica filogenetica, perché considerati polifiletici (origini multiple) o parafiletici (incompleti) (i dicotiledoni sono stati sostituiti da dicotiledoni veri ). Altri sono sopravvissuti con alcuni effetti collaterali, come i funghi . Infine, alcuni hanno resistito alla tempesta, come animali ( metazoi ) o mammiferi . Si noti che non c'era nulla di ovvio che tutti gli animali multicellulari condividessero un antenato comune che li separa da qualsiasi pianta o fungo.
Oltre a questo, la sua struttura rimane fondamentalmente linneana e anche la sua nomenclatura (cioè i nomi stessi).
Esistono diversi approcci tecnici per costruire alberi filogenetici.
Secondo le pubblicazioni, ad oggi troviamo tutti i tipi di classificazioni, dalla classificazione tradizionale che è stata appena rivista, alle classificazioni strettamente cladiste senza ranghi tassonomici, comprese diverse miscele, ad esempio mantenendo i ranghi tassonomici ma allineandosi con i cladi , o metodi di trattamento post-filogenetico che evidenziano automaticamente i gradi in evoluzione .
Le pratiche della disciplina si stanno evolvendo verso una scienza integrativa articolando la raccolta di esemplari sul campo, in varie parti del mondo, con un lavoro di descrizione in laboratorio , associando approcci tradizionali ( morfologia , ecologia , ecc. ), E metodi molecolari più recenti ( codici a barre molecolari ).
I progressi della genetica e della bioinformatica consentono anche di avanzare nella tassonomia, che si traduce anche in frequenti revisioni e aggiornamenti, che a volte avvengono in modalità di pubblicazione scientifica alternative, più cooperative e reattive.
Inoltre, lo studio della biodiversità batterica , o delle specie microbiche nel suolo o negli oceani , è complesso e richiede - oltre a nuovi mezzi di metagenomica ( microbial DNA barcoding ) - una collaborazione tra tanti specialisti sparsi in tutto il mondo. .
I naturalisti hanno sviluppato strumenti per il lavoro collaborativo e la condivisione con, ad esempio, Tela botanica (per i botanici ) e più recentemente l' European Journal of Taxonomy (EJT). È una rivista scientifica internazionale di tassonomia descrittiva, supportata da un Consorzio EJT (di musei di storia naturale e giardini botanici ), pubblicata in inglese, in formato elettronico, sotto licenza Open Access , sotto licenza Creative Commons (3.0), cioè aperta accesso, pubblicazione gratuita e consultazione gratuita. Si occupa dei campi della zoologia , entomologia , botanica e paleontologia . Gli articoli sono opere originali, che devono rispondere a criteri di alta qualità in termini di contenuto scientifico e forma (stile, illustrazioni, ecc.). La rivista è europea, ma gli argomenti possono riguardare tutte le specie, indipendentemente dal loro paese di origine. Le revisioni tassonomiche, le monografie e gli articoli tematici o di opinione possono così essere condivisi meglio e più rapidamente.
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