Citocromo f
C -Terminal dominio del citocromo f
Struttura del dominio solubile del citocromo f di Phormidium laminosum , un cianobatterio ( PDB 1Cl3 ).
| Pfam | PF01333 |
|---|---|
| Clan Pfam | CL0105 |
| InterPro | IPR002325 |
| PROSITÀ | PDOC00169 |
| SCOP | 1ctm |
| SUPERFAMIGLIA | 1ctm |
| TCDB | 3.D.3 |
| Famiglia OPM | 345 |
| Proteina OPM | 3h1d |
Il citocromo f ( citocromo f ) è il più grande subunità del complesso citocromo b 6 f ( EC ), quest'ultimo essendo funzionalmente e strutturalmente correlata alla complessa citocromo bc 1 di mitocondri ; il citocromo f svolge un ruolo simile a quello del citocromo c 1 sebbene abbiano una struttura diversa.
È stata determinata la struttura tridimensionale del citocromo f della rapa ( Brassica rapa ). Il segmento del lato lume presenta due domini strutturali: uno più piccolo su uno stesso più grande posto sul segmento che fa il collegamento con il dominio della membrana . Il dominio più grande è costituito da un sandwich beta antiparallelo e un breve peptide legante l' eme . Il dominio più piccolo è un foglio beta inserito tra i filamenti beta F e G del dominio più grande. L'eme è inserito tra due piccole eliche e l' estremità N- terminale del citocromo f .
All'interno della seconda elica, le sequenze Cys - Xaa - XAA - Cys - I suoi ( residui da 21 a 25) contiene aminoacidi covalentemente legati a eme da tioestere legame con cisteina-21 e cisteina-24 . L'istidina-25 è il 5 ° ligando del catione di ferro dell'eme, il 6 ° ligando è l' ammina del gruppo della tirosina -1 della prima elica.
Il citocromo f contiene una rete interna di molecole d'acqua che potrebbero agire come un canale protonico ; questa struttura sembra essere conservata nei diversi citocromi f studiati.
Note e riferimenti
- (in) Roger C. Prince e Graham N. George , " Cytochrome f Revealed " , Trends in Biochemical Sciences , vol. 20, n o 6, Giugno 1995, p. 217–218 ( leggi in linea ) DOI : 10.1016 / S0968-0004 (00) 89018-0
- (in) SE Martinez, D. Huang, Mr. Ponomarev, WA Cramer e JL Smith , " Il centro redox dell'eme del citocromo f del cloroplasto è collegato a una catena di acqua sepolta a cinque " , Protein Science , Vol. 5, n o 6, Giugno 1996, p. 1081-1092 ( PMCID 2143431 , leggi in linea ) DOI : 10.1002 / pro.5560050610
- (it) Bendall, DS, " La storia incompiuta del citocromo f " , Photosynth. Ris. , vol. 80, n osso 1-3,2004, p. 265–276 ( PMID 16328825 , DOI 10.1023 / B: PRES.0000030454.23940.f9 )
- (it) Cramer, WA, Martinez, SE, Huang, D., Tae, GS, Everly, RM, Heymann, JB, Cheng, RH, Baker, TS e Smith, JL, " Aspetti strutturali del complesso citocromo b 6 f ; struttura del dominio lato lume del citocromo f ” , J. Bioenerg. Biomembr. , vol. 26, n o 1,1994, p. 31–47 ( PMID 8027021 , DOI 10.1007 / BF00763218 )