Il sistema di determinazione del sesso aplodiploide determina il sesso della prole di molti imenotteri ( api , formiche e vespe ), acari , scarafaggi ( coleotteri della corteccia ) e rotiferi . In questo sistema, il sesso è determinato dal numero di cromosomi che un individuo riceve. Una prole formata dall'unione di uno spermatozoo e un uovo si sviluppa come una femmina e un uovo non fecondato si sviluppa come un maschio. Ciò significa che i maschi hanno la metà del numero di cromosomi di una femmina e sono aploidi. Questo sistema aplodiploide di determinazione sessuale si traduce in una serie di peculiarità, la principale delle quali è che un maschio non ha un padre e non può avere un figlio, ma ha un nonno e può avere dei nipoti. Si ritiene che sia stata l'aplodiploidia ad aprire la strada all'evoluzione dell'eusocialità negli imenotteri e in pochi altri taxa, sebbene questa domanda sia oggetto di molti dibattiti.
Sono stati proposti diversi modelli per i meccanismi genetici della determinazione del sesso aplodiploide. Il modello più comune è il cosiddetto modello allele complementare . Secondo questo modello, se un individuo è eterozigote per un locus specifico , si sviluppa in una femmina, mentre gli individui emizigoti e omozigoti si sviluppano in maschi. In altre parole, la prole diploide si sviluppa da uova fecondate e normalmente è composta da femmine, mentre la prole aploide si sviluppa in maschi da uova non fecondate. I maschi diploidi sarebbero sterili perché le loro cellule non sarebbero soggette a meiosi durante la formazione dello sperma, che per questo motivo sarebbe diploide, dando luogo a prole triploide . Poiché negli Imenotteri una madre ei suoi figli condividono gli stessi geni, possono essere particolarmente sensibili alla consanguineità : la consanguineità riduce il numero di alleli di sesso diverso presenti in una popolazione, aumentando quindi la frequenza dei maschi diploidi.
Dopo l' accoppiamento , le femmine fecondate immagazzinano lo sperma negli imenotteri in una tasca interna chiamata spermatheca . La femmina fecondata controlla il rilascio di sperma immagazzinato in questo organo: se rilascia sperma mentre un uovo si sposta nell'ovidotto , quell'uovo viene fecondato. Api, vespe e formiche, che hanno una vita sociale, possono alterare i rapporti tra i sessi nelle colonie per massimizzare la parentela tra i membri e per generare una forza lavoro adeguata alle condizioni circostanti.