Paphinia seegeri è un'orchidea della sotto-tribù Stanhopeinae.
Nome dato in omaggio a Hans-Gerhardt Seeger, responsabile delle orchidee al Giardino Botanico di Heidelberg fino al 2002.
Differt ab omnibus speciebus adhuc notis emergentiis apicis labelli brevibus verrucosis e floribus paene clausis translucenter albis roseo-maculatis. Habitus aliis speciebus generis Paphinia similis. Pendenti infiorescenti. Tepala inter se clinata, traslucido alba maculis striisque pallidi-roseis. Labellum rubinum, bipartitum; hypochilium glabrum lobis falcatis sursumflexis apicibus acutis apichilium contro attentis; callus cristatus, variabilis, hypochilio emergens supra epichilium porrigens; epichilium surface aspera, triangulum, dimidia parte anteriore emergentiis clavatis verrucosis albis usque ad 2 mm longis marginatum. Columna procera flexa alis rotundatis, rostellum tridentatum, pollinarium generis.
Colombia occidentale.