Il gel per elettroforesi è una variante delle zone di elettroforesi .
Ampiamente utilizzata in biochimica o biologia molecolare , questa tecnica di elettroforesi permette di separare le molecole in base alla loro carica, alle loro dimensioni (chiamate peso molecolare ) o entrambe contemporaneamente facendole migrare attraverso un gel mediante l'applicazione di un campo elettrico . Il gel è riempito con una fase acquosa salina, molto spesso tamponata , i cui ioni agiscono come elettrolita e conducono corrente . Le molecole analizzate migrano nel gel sotto gli effetti combinati della forza esercitata dal campo elettrico e delle forze di attrito esercitate dalla matrice gel.
I gel principali utilizzati sono il gel di agarosio e il gel di poliacrilammide (PAGINA).
A seconda del numero di livelli di separazione, l'elettroforesi su gel può essere unidimensionale o bidimensionale .
L'elettroforesi può essere eseguita in condizioni native o in condizioni di denaturazione . In questo secondo caso si parla di elettroforesi su gel a gradiente denaturante . Le condizioni native rispettano la struttura della molecola mentre le condizioni denaturanti denaturano le molecole grazie all'aggiunta di un agente denaturante nel tampone.
Regolando i parametri dell'elettroforesi su gel, è possibile lavorare:
Questa tecnica può essere utilizzata per scopi analitici o preparatori. In quest'ultimo caso, viene utilizzato principalmente per separare aminoacidi , proteine o acidi nucleici ( DNA o RNA ).
Molecola | Principali tipi di Gel | Agente denaturante in caso di elettroforesi su gel a gradiente denaturante |
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Elettroforesi delle proteine | Poliacrilammide | Un tensioattivo non ionico o ionico, come sodio dodecil solfato (SDS) elettroforesi su gel di poliacrilammide (SDS-PAGE) |
Elettroforesi su gel di acidi nucleici (in) | Agarosio o poliacrilammide | Un agente caotropico come l' urea |