La Mission Sainte-Marie è una postazione missionaria cattolica fondata nel territorio di quella che oggi è la città di Sault Ste-Marie nel Michigan dal missionario gesuita Jacques Marquette nel 1668 .
Nel 1667, padre Claude Allouez, di ritorno in Quebec dopo due anni di apostolato presso la missione Saint-Esprit, attraversò questo luogo che individuò come luogo adatto all'insediamento di una nuova missione. Padre Allouez, infatti, ha notato la presenza di un folto gruppo di amerindi, più di duemila, che si incontrano in questo luogo perché è un nodo di comunicazione per le reti commerciali di quest'ultimi con gli europei e perché il pesce è abbondante. Il luogo è anche un centro cerimoniale per molte tribù di nativi americani tra il 1640 e il 1670.
Tornato in Quebec nel 1667, padre Allouez condivise le sue osservazioni con il superiore delle missioni dei gesuiti nella Nuova Francia, che acconsentì alla sua richiesta e incaricò Jacques Marquette di fondarvi una nuova missione. Quest'ultimo lascia Montreal su21 aprile 1668verso i Grandi Laghi e costruì nello stesso anno una cappella e una casa fortificata. Nel 1669, padre Claude Dablon ne fece la capitale delle attività missionarie dei gesuiti nella regione dei Grandi Laghi, allora chiamata Pays d'en Haut .
Il 4 giugno 1671, il sito della missione è teatro della cerimonia di presa di possesso del Pays d'en Haut in nome del re di Francia , cerimonia di grande importanza per la Nuova Francia e per i rapporti dei francesi con le tribù native americani dei Grandi Laghi.
Nel 1674, l'edificio principale della missione fu distrutto durante una lite tra amerindi, il missionario che vi risiedeva riuscendo a malapena a evitare di morire nell'incendio. I gesuiti trasferirono poi la capitale delle missioni del Pays d'en Haut alla missione di Saint-Ignace . L'edificio della missione fu ricostruito e rimase in uso per qualche altro anno, ma i missionari di stanza a Sault Sainte-Marie non avrebbero mai avuto una reale influenza sui nativi americani che vivevano nelle vicinanze.