Il Magistrato dell'Acqua (in italiano Magistrato alle Acque ) è un'istituzione veneziana creata nel 1501 dalla Repubblica di Venezia per vigilare sulla gestione e sul rispetto della sua laguna . Cinque secoli dopo, sotto lo stesso nome, questo ente divenne un servizio dello Stato italiano, responsabile dell'intero spartiacque dell'Italia nord-orientale .
Nel 1501 la Serenissima Repubblica di Venezia decise di istituire un collegio di tre Esecutori delle Acque ( Savi Esecutori ) per assicurare il governo delle acque lagunari, potere precedentemente esercitato dal Consiglio dei Dieci . Nominati dal Doge , questi tre funzionari furono assistiti dal 1505 da un solenne Collegio delle Acque composto da quindici senatori della Repubblica . Nel 1543 il numero di questi senatori verrà portato a quaranta, a cui si aggiungeranno gli avvocati del comune, un amministratore nominato dal Consiglio dei Dieci, un magistrato inquirente ( Inquisitore ) e il rappresentante del Doge.
È questo gruppo che la Serenissima designa, nel corso della sua storia, con il termine di Magistrato delle acque. Questo collettivo di controllo unitario ha l'obbligo di riunirsi ogni settimana su convocazione del Doge.
A questo ente è affidata la supervisione e l'amministrazione dell'intera laguna veneta e dei fiumi che vi sfociano. Ha piena autorità sui lavori, scavi, movimentazioni, operazioni di miglioramento, modifiche temporanee o permanenti, effettuati nella laguna e nei fiumi che la alimentano. Esercita il suo controllo sul più piccolo dettaglio riguardante l'acqua: nella stessa Venezia, nessun palo che sostiene le case può essere spostato senza la sua autorizzazione. Notevole potere del Magistrato dell'Acqua, la sua complessa composizione riflette l'attenzione prestata dalla Repubblica al mantenimento delle acque della laguna. Questi infatti garantiscono la sopravvivenza della città e del suo sistema socio-economico. Costituiscono inoltre l'ultimo baluardo contro una possibile minaccia esterna, un'antica paura dei fondatori della città, che li ha portati a costruirla sopra e in mezzo alle acque.
Nel 1907, istituzione decentrata del Ministero dei Lavori Pubblici italiano, il Magistrato dell'Acqua è ora guidato da un presidente nominato dal Presidente della Repubblica italiana con il consenso del Consiglio dei Ministri. Ha sede a Venezia e si occupa dell'intero bacino del Triveneto . Le sue competenze sono inizialmente esercitate nella regione Veneto e nella provincia di Mantova . Ma quando è probabile che i lavori esterni interessino questo bacino di interesse nazionale, possono estendersi alla provincia autonoma del Trentino-Alto Adige oltre che alla regione a statuto speciale Friuli-Venezia Giulia .
Le attribuzioni di questo ente riguardano, come cinque secoli fa, la gestione e il monitoraggio della laguna, a cui si aggiungono oggi le imperative operazioni di bonifica, miglioramento e regolazione portuale, sia in termini di impianti che di traffico.