Lokiarchaeota

Lokiarchaeota Classificazione
Regno Archaea

Ramo

Lokiarchaeota
Spang et al. 2015

Classificazione filogenetica

Posizione:

Lokiarchaeota è un phylum di Archaea definito nel 2015.

Descrizione

Essendo stato scoperto da analisi metagenomiche , le sue caratteristiche morfologiche non sono note. La nomenclatura di questo taxon è stata formalmente introdotta nel 2015, dopo l'identificazione di un genoma considerato Candidatus per l'analisi metagenomica di un campione di sedimento del fondo marino .

Il campione di sedimento è stato ottenuto nei pressi di una sfogo idrotermale in una formazione di roccia conosciuta come Castello di Loki ( Castello di Loki in inglese) sul Gakkel Ridge nel Mar Glaciale Artico .

L'importanza del phylum Lokiarchaeota deriva dal fatto che l' analisi filogenetica dimostra l'esistenza di un gruppo monofiletico composto da lokiarchaeotes ed eucarioti , nonché la presenza di diversi geni con funzioni associate alla membrana cellulare . Permette di portare una pietra all'edificio della conoscenza dell'origine degli eucarioti, una delle ipotesi che suggeriscono che l' antenato comune degli eucarioti sia vicino ad Archaea.

Riferimenti

  1. (it) Anja Spang , Jimmy H. Sega , Steffen L. Jørgensen , Katarzyna Zaremba-Niedzwiedzka , Joran Martijn , Anders E. Lind , Roel van Eijk , Christa Schleper , Lionel Guy e Thijs JG Ettema , “  archeobatteri Complex che colmano il divario tra procarioti ed eucarioti  " , Natura ,2015( ISSN  0028-0836 , DOI  10.1038 / nature14447 , leggi online [PDF] )
  2. (en) Steffen Leth Jørgensen , Bjarte Hannisdal Anders Lanzen , Tamara Baumberger , Kristin Flesland , Rita Fonseca , Lise Øvreås , Ida H Steen , Ingunn H Thorseth , Rolf B Pedersen e Christa Schleper , "  correlano i profili delle comunità microbiche con dati geochimici sedimenti stratificati dalla dorsale artica medio-oceanica  " , PNAS , vol.  109, n .  42,5 settembre 2012, E2846 - E2855 ( DOI  10.1073 / pnas.1207574109 , leggi in linea )
  3. (in) Steffen Leth Jørgensen , H Ingunn Thorseth Rolf B Pedersen , Tamara Baumberger e Christa Schleper , "  Studio quantitativo e filogenetico del gruppo archeologico del mare profondo nei sedimenti della dorsale oceanica artica che si estende  " , Frontiers in Microbiology ,4 ottobre 2013( DOI  10.3389 / fmicb.2013.00299 , leggi online )
  4. Fabien Goubet, "  Loki, un vecchio cugino del fondo del mare  " , a Le Temps ,7 maggio 2015(visitato il 22 luglio 2015 )
  5. "  Una nuova organizzazione degli esseri viventi  " , su Le Temps ,7 maggio 2015(visitato il 22 luglio 2015 )
  6. (in) Paul Rincon , "  Il microbo appena scoperto è parente stretto della vita complessa  " , su BBC News ,6 maggio 2015(visitato il 9 maggio 2015 )
  7. (in) Carl Zimmer , "  Under the Sea, a Missing Link in the Evolution of Complex Cells  " sul New York Times ,6 maggio 2015(accesso 8 maggio 2015 )
  8. (in) S. Kelly , B. Wickstead e K. Gull , "  Archaeal Phylogenomics Fornisce prove di un portatore in metanogeno Archaea e l'origine dell'origine ha taumarchaeal per gli eucarioti  " , Atti della Royal Society B , vol.  278,2011, p.  1009-1018 ( DOI  10.1098 / rspb.2010.1427 , letto online , accesso 5 ottobre 2012 )
  9. (in) John M. Archibald , "  L'ipotesi degli eociti e l'origine delle cellule eucariotiche  " , PNAS , vol.  105, n o  51,23 dicembre 2008, p.  20049-20050 ( DOI  10.1073 / pnas.0811118106 , letto online , accesso 5 ottobre 2012 )
  10. , (in) Anthony M. Poole e Nadja Neumann , "  Riconciliare anno di origine archeologica degli eucarioti con inghiottimento: un aggiornamento dell'ipotesi biologicamente plausibile dell'Eocita  " , Research in Microbiology , vol.  162,2011, p.  71-76 ( DOI  10.1016 / j.resmic.2010.10.002 , letto online , accesso 5 ottobre 2012 )
  11. (in) Lionel Guy Thijs JG Ettema , "  The archaeal 'TACK' superphylum and the origin of eukaryotes  " , Trends in Microbiology , Vol.  19, n o  12,dicembre 2011, p.  580–587 ( PMID  22018741 , DOI  10.1016 / j.tim.2011.09.002 , letto online , accesso 5 ottobre 2012 )
  12. (in) Cymon J. Cox , Peter G. Foster , Robert P. Hirt , Simon R. Harris e T. Martin Embley , "  The Origin of Eukaryotic ARCHAebacterial  " , PNAS , vol.  1105,23 dicembre 2008, p.  20356–20361 ( DOI  10.1073 / pnas.0810647105 , letto online , accesso 5 ottobre 2012 )