| Coomassie Blue | |
| Struttura di Coomassie Blue G-250 | |
| Identificazione | |
|---|---|
| Sinonimi | |
| N o CAS | |
| N o ECHA | 100.025.509 |
| N o EC | 228-058-4 |
| SORRISI |
C (\ c1c (cc (N (Cc2cc (ccc2) S (= O) (= O) [O -]) CC) cc1) C) (= C1 / C (= C \ C (= [N +] ( \ Cc2cc (ccc2) S (= O) (= O) [O -]) CC) C = C1) C) c1ccc (Nc2ccc (OCC) cc2) cc1. [Na +] , |
| InChi |
InChI: InChI = 1 / C47H49N3O7S2.Na / c1-6-49 (31-35-11-9-13-43 (29-35) 58 (51,52) 53) 40-21-25-45 ( 33 (4) 27-40) 47 (37-15-17-38 (18-16-37) 48-39-19-23-42 (24-20-39) 57-8-3) 46-26- 22-41 (28-34 (46) 5) 50 (7-2) 32-36-12-10-14-44 (30-36) 59 (54.55) 56; / h9-30H, 6-8 , 31 -32H2,1-5H3, (H2,51,52,53,54,55,56);/q;+1/p-1 |
| Proprietà chimiche | |
| Formula |
C 47 H 49 N 3 Na O 7 S 2 |
| Massa molare | 855.028 ± 0,054 g / mol C 66,02%, H 5,78%, N 4,91%, Na 2,69%, O 13,1%, S 7,5%, 856.03 g/mol |
| Unità di SI e STP se non diversamente indicato. | |
Il blu di Coomassie , o blu brillante, è un colorante blu comunemente usato per macchiare i tessuti (industria) e le proteine (analisi chimica). Legandosi alle proteine, il blu di Coomassie permette di dosarle in soluzione mediante colorimetria (metodo Bradford), o di visualizzarle in gel elettroforetico tipo SDS-PAGE (Sodium DodedecilSulfate-PolyAcrylAmide Gel).
Il blu di Coomassie è un trifenilmetano che si presenta in due forme: G-250 (chiamato anche Brilliant Blue G, Acid Blue 90, CI 42655 o Brilliant Blue G 250) e R-250 (Brilliant Blue R, CI 42660, CI Acid Blue 83 , Brillante indocianina 6B). Ne esistono altri, ad esempio Coomassie Blue RL (Acid Blue 92, CI 13390), di struttura molto diversa.
Le 2 forme R-250 e G-250 si differenziano per il colore (blu sfumato di verde per R250, blu sfumato di rosso per G-250), e per il pH (il G-250 diventa leggermente colorato tra pH 2 e 3 ). Ciò si basa sulla loro differenza di struttura (2 gruppi metilici per G-250), che influisce anche sulla colorazione data alle proteine in base alla loro composizione: l'interazione Coomassie/proteine comporta interazioni ioniche (tramite i 2 gruppi sulfonile e gruppi azotati), ma anche complessi idrofobici - che coinvolgono aminoacidi aromatici (fenilalanina, tirosina, triptofano) e catena basica (soprattutto arginina, lisina, istidina). Infine, G-250 è più solubile in acqua.
Le 2 forme R-250 e G-250 possono essere utilizzate nella stessa applicazione, ma non in modo intercambiabile perché in particolare non colorano le proteine allo stesso modo.
Il blu di Coomassie G-250 è ampiamente utilizzato per la determinazione delle proteine in soluzione mediante colorimetria ( metodo Bradford ). R-250 è invece utilizzato per la colorazione di proteine su gel elettroforetico, e più recentemente anche G-250 (senza passaggio di decolorazione).
(il lavaggio può essere effettuato anche con acqua, a caldo)
Una soluzione di etanolo al 10% di acido acetico al 10% è molto efficace, soprattutto se riscaldata (forno a microonde per pochi minuti), e molto meno tossica del metanolo.
Il blu di coomassie è stato utilizzato per diverse altre applicazioni: in campo medico (esperimenti su ratti), nello screening delle impronte digitali (permettendo di distinguere tra impronte maschili e femminili, quest'ultime più ricche di aminoacidi aromatici e basiche).
Come per molti coloranti, il blu di Coomassie prende il nome dalla località africana di Kumasi , attualmente nel territorio del Ghana ; è stato sviluppato come colorante per la lana acida, ed è stato chiamato in commemorazione dell'occupazione britannica della capitale di Ashanti nel 1896, allora chiamata Coomassie.