Regno | Batteri |
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Ramo | Proteobatteri |
Classe | Gammaproteobacteria |
Ordine | Xanthomonadales |
Famiglia | Xanthomonadaceae |
Genere | Xanthomonas |
Specie | Xanthomonas oryzae |
Xanthomonas oryzae pv oryzae è uno dei due pathovar attaccati a Xanthomonas oryzae , specie di proteobatteri , appartenenti alla famiglia delle Xanthomonadaceae .
Questo batterio, il cui principale ospite è il riso ( Oryza sativa ), è responsabile di una delle malattie più gravi del riso , chiamata malattia batterica del riso (o malattia batterica del riso), o " kresek " nel sud-est asiatico. È presente nella maggior parte delle regioni di coltivazione del riso del mondo, ad eccezione del bacino del Mediterraneo .
In condizioni favorevoli alla malattia, le perdite di rendimento possono raggiungere il 70%.
Il genoma di questo batterio (ceppo MAFF 311018) è stato sequenziato nel 2005 da un team giapponese . Questo genoma, costituito da un singolo cromosoma circolare, ha una dimensione di 4.940.217 bp . La sua struttura è caratterizzata da un gran numero di geni effettori (avr). Questo batterio è considerato un organismo modello per l'analisi dell'interazione pianta-patogeno perché più di 30 razze diverse sono note per la loro virulenza e che nel riso sono stati identificati 25 geni di resistenza (di cui è stato identificato anche il genoma. Sequenza).
Oltre al riso coltivato, Xanthomonas campestris pathovar oryzae ammette come piante ospiti varie specie di Poaceae (Graminacee) e Cyperaceae (Carex).
Tra i Poaceae , troviamo in particolare: Cenchrus ciliaris (Rhodesian Cenchrus), Cynodon dactylon (quackgrass), Echinochloa crus-galli (gallo erba), Leersia hexandra , Leersia japonica , oryzoides Leersia (false Leersia riso), Leersia sayanuka , Leptochloa chinensis , Leptochloa panicea , Oryza sp. (specie del genere Oryza , in particolare Oryza rufipogon e Oryza australiensis in Australia), Panicum maximum (Guinea grass), Paspalum scrobiculatum (spada), Urochloa mutica (Para grass), Zizania aquatica (riso selvatico), Zizania palustris (selvatico riso) e Zoysia japonica (zoysia giapponese);
e tra le Cyperaceae : Cyperus difformis (nutgrass a fiore piccolo), Cyperus rotundus (nutgrass).
Leersia sayanuka è l'ospite più importante del Giappone perché questa specie garantisce la sopravvivenza dei batteri durante l'inverno e si trova comunemente nelle aree in cui la malattia è endemica.