Un segretario generale della prefettura è un funzionario della amministrazione francese .
Il segretario generale della prefettura è il primo collaboratore del prefetto del dipartimento , che assiste nell'esercizio delle sue missioni generali. Sotto l'autorità di quest'ultimo, è responsabile della conduzione delle politiche interdipartimentali, della gestione di grandi registri dipartimentali e dell'impulso dato alle azioni dello Stato nel dipartimento. Beneficia di una grande delega di firma. Si occupa dei rapporti con gli agenti della prefettura e gestisce il bilancio e il patrimonio della prefettura.
Il segretario generale della prefettura sostituisce il prefetto in caso di sua assenza o vacanza. È il sottoprefetto del distretto amministrativo.
È assistito dai servizi amministrativi della prefettura, raggruppati in un certo numero di direzioni, i cui titoli variano a seconda delle prefetture. Ha ai suoi ordini un controllore di gestione responsabile del controllo e della valutazione della gestione.
La funzione di segretario generale della prefettura è istituita dalla legge 28 pluviôse An VIII (17 febbraio 1800). Un ordine da20 dicembre 1815decide, per ragioni di economia, di unire le funzioni di sottoprefetto di circoscrizione del capoluogo di contea e di segretario generale di prefettura: i segretari generali di prefettura sono assimilati a sotto-prefetti. I segretari generali della prefettura sono aboliti dall'ordinanza del1 ° agosto 1817, poi ripristinato dall'ordinanza del 1 ° maggio 1820.