Nucleasi micrococcici

Nucleasi micrococcici Nucleasi nucleare micrococcico a temperatura criogenica ( PDB  3H6M ) Dati chiave

CE n.	CE 3.1.31.1
numero CAS	9013-53-0

Attività enzimatica

IUBMB	Voce IUBMB
IntEnz	Vista IntEnz
BRENDA	Ingresso BRENDA
KEGG	Ingresso KEGG
MetaCyc	Passaggio metabolico
PRIAM	Profilo
PDB	Strutture

La Nuclease micrococcal ( commissione enzimatica numero 3.1.31.1 ) è un endo - esonucleasi che agisce preferibilmente su acidi nucleici a singolo filamento producendo mononucleotidi e oligonucleotidi 3 'fosfato. Il tasso di escissione di questo enzima è 30 volte superiore quando agisce sull'estremità 5 'di un'adenina o di una timina rispetto alla guanina o alla citosina . Questo enzima ha anche attività contro l' RNA e il DNA a doppia elica, determinando infine la scissione di tutte le sequenze.

Sinonimi

Altri nomi di questo enzima sono: nucleasi microcococcica, nucleasi S7, MNasi, endonucleasi della milza, termonucleasi, nucleasi T, endonucleasi micrococcica, nucleasi T ', nucleasi stafilococcica, milza fosfodiesterasi, Staphylococcus aurelocus-nucleasi nucleasi, nucleasi aureococcus-nucleasi 3 (deossinucleato)

Caratteristiche

Questo enzima ha un peso molecolare di 16,9 KDa ed è strettamente dipendente da Ca 2+ . Il suo pH ottimale varia con la concentrazione di Ca 2+ ed è quindi facilmente inattivato dall'agente complessante EGTA.

fonte

Questo enzima è la nucleasi extracellulare di Staphylococcus aureus. Due ceppi, V8 e Foggi producono forme praticamente identiche di questo enzima. Una comune fonte di produzione è un ceppo ricombinante di Escherichia coli che possiede il gene della nucleasi stafilococcica.

Struttura

La struttura tridimensionale della nucleasi micrococcica (che allora era conosciuta come nucleasa stafilococcale) fu risolta nel 1969, uno dei primi successi nella storia della cristallografia a raggi X delle proteine, essendo depositata su Protein Data Bank con l'archivio codice 1SNS (ora obsoleto). Sono disponibili strutture più recenti e ad alta risoluzione per la forma apolipoproteina (codice PDB 1SNO) e per la forma inibita legata alla timidina difosfato (codici PDB  3H6M 3H6M o PDB  1SNO 1SNC )

Come si può vedere dal diagramma a nastro sopra, la molecola di questa nucleasi ha 3 eliche alfa e un foglio beta a forma di botte formato da cinque catene, una disposizione chiamata piegatura OB (mediante legame oligonucleotidico , cioè fissativo oligonucleotidico in inglese ), secondo la classificazione del database di classificazione strutturale delle proteine ​​(SCOP).

Applicazioni

• Idrolisi degli acidi nucleici in estratti cellulari grezzi.
• Sequenziamento del RNA (dovuta alla degradazione del DNA)
• Preparazione di lisati di reticolociti di coniglio.
• Studi sulla struttura della cromatina .
• Ablazione di acidi nucleici da preparati proteici in laboratorio, per consentire studi di conformazioni proteiche tridimensionali e relazioni struttura-funzione.
• Ricerca sui meccanismi di ripiegamento delle proteine .

Note e riferimenti

1. Heins JN, Suriano JR, Taniuchi H, Anfinsen CB (1967).
2. Cusumano CL, Taniuchi H, Anfinsen CB (1968).
3. Arnone A, Bier J, et al. (1971).

• http://www.thermoscientificbio.com/dna-and-rna-modifying-enzymes/micrococcal-nuclease/ (inglese)

• http://www.worthington-biochem.com/nfcp/default.html (inglese)

• http://www.thermoscientificbio.com/uploadedfiles/resources/en0181-usa-msds.pdf - Scheda degli standard di sicurezza del prodotto (inglese)

• http://www.thermoscientificbio.com/uploadedfiles/resources/en018-product-information.pdf - Scheda informativa del prodotto (inglese)

link esterno

• (in) MeSH Micrococcal + Nuclease : Micrococcal + Nuclease (in inglese)
• Nomenclatura CE 3.1.31.1