La Malesia è una regione biogeografica a cavallo dell'equatore e ai limiti dell'ecozona Indomalayan e dell'ecozona Australasiatica e una regione floristica fitogeografica del regno paleotropicale . Le sono state date diverse definizioni. Lo schema geografico globale per la registrazione delle distribuzioni vegetali ha separato la Papua nella sua versione del 2001.
La Malesia è stata identificata per la prima volta come una regione floristica che comprendeva la penisola malese , l' arcipelago malese , la Nuova Guinea e l' arcipelago di Bismarck , sulla base di una varietà condivisa di flora tropicale proveniente principalmente dall'Asia , ma anche con molti elementi della flora antartica, tra cui molte specie appartenenti alle famiglie di conifere dell'emisfero meridionale, Podocarpaceae e Araucariaceae . La regione floristica copre quattro distinte regioni faunistiche dei mammiferi .
La prima edizione del World Geographical Scheme for the Recording of Plant Distributions (WGSRPD) usava questa definizione, ma nella seconda edizione del 2001 la Nuova Guinea e l'arcipelago di Bismarck furono rimossi dalla Malesia per essere riuniti con le Isole Salomone , precedentemente collocate nel Regione del Pacifico sud-occidentale WGSRPD. Questi tre elementi formano una nuova regione, Papua .
La parte occidentale della Malesia, che comprende la penisola malese e le isole di Sumatra , Giava , Bali e Borneo , condivide la grande fauna dei mammiferi dell'Asia ed è conosciuta come Sondeland . Queste isole si trovano sulla piattaforma continentale relativamente poco profonda dell'Asia e vi erano collegate durante l' era glaciale , quando il livello del mare era più basso. Il confine orientale di Sondeland è la Wallace Line , che prende il nome dal naturalista britannico del XIX secolo Alfred Russel Wallace , che ha notato la differenza di fauna selvatica tra le isole su entrambi i lati della linea. Le Dipterocarpaceae sono gli alberi predominanti nelle foreste di pianura di Sondeland.
La maggior parte delle Filippine non è mai stata collegata al continente asiatico e ha una flora prevalentemente asiatica e una distinta fauna di mammiferi.
Le isole tra Sundaland e la Nuova Guinea, chiamate Wallaceae , non sono mai state collegate ai continenti vicini e hanno flora e fauna inclusi elementi Indomalayan e Australasian.
Le Isole Salomone, la Nuova Guinea e l'arcipelago di Bismarck sono collocate insieme in Papua piuttosto che in Malesia nella seconda versione del WGSRPD. La parte orientale della vecchia definizione di Malesia, che comprende la Nuova Guinea e le isole Aru dell'Indonesia orientale, è collegata all'Australia da una piattaforma continentale poco profonda e condivide molti taxa di mammiferi e uccelli marsupiali con l'Australia. La Nuova Guinea ha anche molti altri elementi della flora antartica, tra cui il faggio meridionale ( Nothofagus ) e gli alberi di eucalipto . La Nuova Guinea ha le montagne più alte della Malesia e della Papuasia e la sua vegetazione spazia dalla foresta pluviale di pianura alla tundra.