Il kabupaten di Manokwari è un kabupaten (reggenza) della Papua occidentale la cui capitale è Manokwari , la capitale della provincia.
Nel censimento del 2010, questa reggenza aveva 29 distretti ( kecamatan ) ma nel 2013 sono state create due nuove reggenze: South Manokwari Regency (Manokwari Selantan) con 6 distretti e Arfak Mountains Regency (Pegunungan Arfak) con 10 distretti - dalla reggenza di Manokwari.
La reggenza residua ha 9 distretti.