L' Islam è stabilito in Madagascar sin dal Medioevo. La percentuale di musulmani nella popolazione è stimata tra il 10 e il 13%.
Secondo le tradizioni locali, i primi arabi che si stabilirono in Madagascar furono rifugiati dalle guerre civili che seguirono la morte di Maometto nel 632 . Per il X ° secolo o del XI ° secolo , i mercanti arabi avorio o Zanzibar viaggiando lungo la costa orientale dell'Africa, nei loro dhow e stabilito colonie sulla costa occidentale del Madagascar. Tra queste colonie, la più famosa è quella di Zafiraminia, da cui provengono le etnie Antemoro e Antanosy . L'ultima ondata di immigrati arabi è l' Antalaotra , proveniente dalle colonie dell'Africa orientale. Si stabilirono nel nord-ovest dell'isola, nella regione di Mahajanga , e furono i primi a importare effettivamente l' Islam nell'isola.
Gli immigrati arabi musulmani erano piccoli in numero rispetto agli indonesiani e ai Bantus , ma hanno lasciato un segno indelebile : i nomi malgasci delle stagioni, dei mesi e dei giorni, la pratica della circoncisione , le monete, i silos comuni per il grano e diverse forme di saluto. I maghi arabi, chiamati ombiasy , si stabilirono nelle corti di molti regni tribali in Madagascar. Gli arabi musulmani portarono in Madagascar il sistema familiare patriarcale . Era contrario al sistema matriarcale polinesiano in cui il privilegio della proprietà è distribuito equamente tra uomini e donne. Gli arabi sono anche l'origine di Sora-be , un alfabeto basato sull'alfabeto arabo , utilizzato per trascrivere il dialetto malgascio e antaimoro . Gli arabi furono anche i primi a identificare correttamente i malgasci suggerendo che l'isola fosse stata colonizzata dagli indonesiani.
In seguito alla indipendenza del Madagascar nel 1960 dopo la sua colonizzazione da parte della Francia, Madagascar sviluppato grazie ai forti legami con il comunismo potere della Unione Sovietica , che soffocato lo sviluppo di qualsiasi religione, in Madagascar. Tuttavia, negli anni '80, il Madagascar ha preso le distanze dall'Unione Sovietica e ha rinnovato i partenariati con la Francia. Ora è una repubblica che garantisce la libertà di culto.