C'è una piccola comunità ebraica di circa 20 famiglie in Indonesia . Vive principalmente a Surabaya , seconda città e secondo porto del paese e capitale della provincia di East Java .
Secondo il censimento ufficiale del 2010, l'87,2% degli indonesiani è musulmano, il 7% protestante, il 2,9% cattolico, l'1,7% indù, l'1,3% altro o senza risposta, che include buddismo, giudaismo e cristianesimo ortodosso.
Nel 1850 , un emissario di Gerusalemme , Jacob Saphir, visitò Batavia (ora Giacarta) in quelle che allora erano le Indie orientali olandesi e lì incontrò un mercante ebreo di Amsterdam che citò il numero di 20 famiglie ebree olandesi o tedesche. e pochi altri ebrei a Semarang (Giava centrale) e Surabaya. Queste famiglie non sono molto religiose. Su richiesta di questo emissario, la comunità ebraica di Amsterdam ha inviato un rabbino per cercare di organizzare le comunità a Batavia e Semarang . Successivamente, gli ebrei di Baghdad e Aden vennero a unirsi ai loro correligionari nella colonia olandese.
Nel 1921 , l'inviato sionista Israel Cohen stimò che 2.000 ebrei vivessero a Giava. Il governatore di Surabaya era allora un ebreo, molti altri membri della comunità erano alti funzionari e altri commercianti. Gli ebrei più religiosi di Baghdad costituiscono il nocciolo duro della comunità. Negli anni '30 il numero di ebrei dell'Europa orientale e dell'Unione Sovietica aumentò.
Nel 1957 , non c'erano più di 450 ebrei in tutta l'Indonesia, che divenne indipendente nel 1945. La comunità di Jakarta era composta principalmente da Ashkenazim , quella di Surabaya dei sefarditi . Nel 1963, la comunità non aveva più 50 membri e nel 1997 20, parte a Giacarta e il resto a Surabaya, dove avevano una sinagoga . Reazioni ostili agli ebrei iniziarono ad emergere negli anni '80 e '90 in reazione al conflitto israelo-palestinese . Nel 2009, gli islamisti indonesiani hanno chiuso la secolare sinagoga di Surabaya come rappresaglia per la guerra di Gaza del 2008-2009 , un'operazione militare israeliana contro Hamas palestinese. Questa sinagoga non era più utilizzata per i servizi ma era ancora utilizzata per i funerali. Sul posto c'è ancora un cimitero ebraico in cattive condizioni.
Nel 2010 nel paese è rimasta solo una sinagoga funzionante. Situato a Manado all'estremità settentrionale dell'isola di Celebes, è stato costruito negli anni 2000 ed è frequentato da una decina di persone. In questa città la cui popolazione è prevalentemente di obbedienza evangelica , sta emergendo un piccolo movimento di ritorno alle proprie radici ebraiche tra alcuni abitanti discendenti di ebrei convertiti all'Islam o al Cristianesimo all'indipendenza dell'Indonesia. Sono supportati dal rabbino Lubavitcher di Singapore che li guida nel processo di conversione all'ebraismo ortodosso. Questo movimento è visto positivamente dalle autorità locali. Le simpatie pro-ebraiche e pro-Israele sono davvero forti in questa regione dove sono stati stabiliti movimenti evangelici e carismatici di origine europea e americana negli anni '90 . Il governo del Nord Sulawesi ha eretto sulle alture della città una menorah alta 18 metri in riferimento a quella che adorna l'ingresso della knesset , il parlamento israeliano. Questa costruzione è in parte motivata dalla speranza di portare nel sito turisti e uomini d'affari europei. Secondo alcuni esperti, questo crescente entusiasmo della popolazione locale per i movimenti evangelici filo-israeliani è una reazione all'ascesa dell'Islam ortodosso nel resto dell'arcipelago.