Fattore di iniziazione

"  Fattori di inizio  " o iniziano fattori , spesso indicati con l'acronimo di IF , sono proteine che coadiuvano la ribosoma per l'apertura di traduzione di mRNA in proteine. Questo passaggio è fondamentale, perché è questo passaggio che consente al macchinario cellulare di riconoscere il giusto codone di inizio e fissarsi così sul messaggio da tradurre. L'inizio coinvolge solo la piccola subunità del ribosoma, 30S nei procarioti e 40S negli eucarioti, e consente la formazione del complesso ternario tra questa subunità ribosomiale, l'RNA messaggero e l' inizio dell'RNA di trasferimento sul primo codone del gene. Durante questa fase, il tRNA si lega al sito P del ribosoma e non al sito A, come durante le successive fasi di estensione della traduzione. I fattori di inizio sono essenziali per questo assemblaggio e sono associati al ribosoma durante tutto il processo. Una volta formato il complesso ternario, viene reclutata la grande subunità ribosomiale (50S nei procarioti, 60S negli eucarioti) e i fattori di avviamento si dissociano. Può iniziare la fase di allungamento della catena proteica.

I dettagli del meccanismo di iniziazione sono significativamente diversi nei procarioti , da un lato, e negli eucarioti e negli archaea , dall'altro. Di conseguenza, i fattori di partenza sono molto diversi in queste diverse aree della vita.

Semantica

La denominazione "fattore di iniziazione" è un abuso di traduzione, derivato dal fattore di iniziazione inglese , ma è passato all'uso comune a causa della nomenclatura in "IF" o "eIF". Iniziazione in inglese in questo contesto significa inizio o inizio, mentre il termine francese non ha lo stesso significato che in inglese (vedi l'articolo Iniziazione ). La denominazione corretta sarebbe "fattore di avviamento". Allo stesso modo si parla, preferibilmente, di "iniziare la traduzione" e non di "iniziare la traduzione", che è un anglicismo.

Procarioti

Nei procarioti o nei batteri , sono stati identificati tre fattori che si associano alla piccola subunità 30S del ribosoma durante la formazione del complesso di inizio traslazione. Sono stati chiamati IF1, IF2 e IF3 .

Questi fattori funzionano secondo il seguente schema:

Dopo il legame del fMet-tRNA alla subunità 30S, il fattore IF3 si dissocia dal complesso. Il legame di questo primo tRNA e la partenza di IF1 consentiranno il reclutamento della grande subunità 50S. Infine, l'idrolisi di GTP in GDP + Pi porta al rilascio di IF2 e quindi all'avvio della traduzione.

Eucarioti

Negli eucarioti, i fattori di iniziazione sono: eIF1, eIF1A, eIF2, eIF3, eIF4A, eIF4B, eIF4E, eIF4G e eIF5. Inoltre, PABP , la proteina che lega la coda poli (A) ( poli (A) -di legame proteina ) anche partecipa alla formazione del complesso con l'avviamento 40S subunità del ribosoma.

I ruoli dei fattori principali sono:

Vedi anche

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Note e riferimenti