Caenorhabditis

Caenorhabditis Descrizione di questa immagine, commentata anche di seguito Adulti Ermafrodito Caenorhabditis elegans . Classificazione
Regno Animalia
Ramo Nematodi
Classe Secernentea
Ordine Rhabditida
Famiglia rabditidi

Genere

Caenorhabditis
( Osche  (d) , 1952 ) Dougherty , 1955

Sinonimi

Caenorhabditis è un genere di nematodi che vivono in ambienti ricchi di batteri . Contiene l' organismo modello Caenorhabditis elegans , così come molte altre specie il cui genoma è stato sequenziato.

Il nome è formato dalle due radici greche caeno- (καινός (caenos), recente), e rhabditis (ῥάβδος (rhabdos), verga, bastone).

Elenco delle specie

Secondo NCBI (30 ottobre 2019) , il genere appartiene alla sottofamiglia Peloderinae con i generi Pellioditis e Pelodera , e comprende le seguenti specie:

altre specie di Caenorhabditis senza nome:

Secondo ITIS (27 marzo 2011)  :

Genetico

Elenco delle specie sequenziate

Studi filogenetici

Cladogramma delle specie Caenorhabditis secondo Félix et al. (aprile 2014)
Caenorhabditis

elegans

C. inaspettato



C. sp. 35


elegans





C. briggsae



C. nigoni




C. sinica





C. latens



C. remanei






C. wallacei



C. tropicalis





C. brenneri



C. pasteertyi





C. elegans



Japonica





C. nouraguensis



C. yunquensis




C. macrosperma





C. afra



C. imperialis





C. japonica




C. kamaaina




Drosophile




C. drosophilae



C. sp. 2






C. angaria



C. castelli




C. sp. 8






C. portoensis



C. virilis





C. guadeloupensis






C. monodelphis



C. plicata




Cladogramma della specie Caenorhabditis , basato sul confronto di sequenze del " Spaziatore trascritto interno ", una porzione di DNA situata tra i geni della subunità piccola e grande dell'RNA.

Uno studio filogenetico effettuato nel 2014 ha rivelato la presenza di due supergruppi, 'Elegans' e 'Drosophilae, e due gruppi ('Elegans' e 'Japonica') all'interno del supergruppo 'Elegans'. Questo studio rivela anche che C. nigoni è la specie sorella di C. briggsae mentre C. elegans è singolo, basale nel gruppo "Elegans".

Un altro studio del 2019 aggiunge C. inopinata come la specie più vicina a C. elegans . Rivela anche che C. monodelphis è la specie più basale nell'albero filogenetico.

Note e riferimenti

  1. (in) Osche, G., 1952. "Phylogeny Systematik und der Gattung Rhabditis (Nematoda)." Zoologische Jahrbücher (Abt. 1), 81, p.  190-280 .
  2. NCBI , consultato il 30 ottobre 2019.
  3. ITIS , accesso 27 marzo 2011
  4. (it) Stein, LD et al. , "  La sequenza del genoma di Caenorhabditis briggsae : una piattaforma per la genomica comparata  " , PLoS Biology , vol.  1, n o  22003, pag.  166–192 ( PMID  14624247 , PMCID  261899 , DOI  10.1371 / journal.pbio.0000045 , leggi online )
  5. (in) The C. elegans Sequencing Consortium, "  Sequenza del genoma del nematode C. elegans : una piattaforma per indagare sulla biologia  " , Science , vol.  282,1998, pag.  2012–2018 ( DOI  10.1126 / science.282.5396.2012 , leggi online )
  6. (in) Felix, Marie-Anne; Braendle, Cristiano; Cutter, Asher D. (11 aprile 2014). "Un sistema semplificato per la diagnosi delle specie in Caenorhabditis (Nematoda: Rhabditidae) con designazioni di nomi per 15 specie biologiche distinte". PLOS UNO. 9: e94723. DOI : 10.1371 / journal.pone.0094723
  7. (it) Genomica comparativa di 10 nuove specie Caenorhabditis. Lewis Stevens, Marie ‐ Anne Félix, Toni Beltran, Christian Braendle, Carlos Caurcel, Sarah Fausett, David Fitch, Lise Frézal, Charlie Gosse e Taniya Kaur, Evolution Letters, Volume3, Issue2, aprile 2019, pagine 217-236, DOI : 10.1002 /evl3.110 .

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