Caenorhabditis
Caenorhabditis
Adulti
Ermafrodito Caenorhabditis elegans .
Genere
Caenorhabditis ( Osche (d) , 1952 ) Dougherty , 1955
Sinonimi
Caenorhabditis è un genere di nematodi che vivono in ambienti ricchi di batteri . Contiene l' organismo modello Caenorhabditis elegans , così come molte altre specie il cui genoma è stato sequenziato.
Il nome è formato dalle due radici greche caeno- (καινός (caenos), recente), e rhabditis (ῥάβδος (rhabdos), verga, bastone).
Elenco delle specie
Secondo NCBI (30 ottobre 2019) , il genere appartiene alla sottofamiglia Peloderinae con i generi Pellioditis e Pelodera , e comprende le seguenti specie:
- Caenorhabditis afra
- Caenorhabditis angaria
- Caenorhabditis astrocarya
- Caenorhabditis becei
- Caenorhabditis brenneri
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Caenorhabditis briggsae
- Caenorhabditis briggsae AF16
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Caenorhabditis briggsae x Caenorhabditis nigoni
- Caenorhabditis castelli
- Caenorhabditis dolens
- Caenorhabditis pasteertyi
- Caenorhabditis drosophilae
- Caenorhabditis elegans
- Caenorhabditis guadeloupensis
- Caenorhabditis imperialis
- Caenorhabditis inopinata
- Caenorhabditis japonica
- Caenorhabditis kamaaina
- Caenorhabditis latens
- Caenorhabditis macrosperma
- Caenorhabditis maupasi
- Caenorhabditis monodelphis
- Caenorhabditis nigoni
- Caenorhabditis nouraguensis
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Caenorhabditis nouraguensis x Caenorhabditis becei
- Caenorhabditis panamensis
- Caenorhabditis parvicauda
- Caenorhabditis plicata
- Caenorhabditis portoensis
- Caenorhabditis quiockensis
- Caenorhabditis remanei
- Caenorhabditis sinica
- Caenorhabditis sonorae
- Caenorhabditis sulstoni
- Caenorhabditis tribulationis
- Caenorhabditis tropicalis
- Caenorhabditis uteleia
- Caenorhabditis virilis
- Caenorhabditis vivipara
- Caenorhabditis waitukubuli
- Caenorhabditis wallacei
- Caenorhabditis yunquensis
- Caenorhabditis zanzibari
altre specie di Caenorhabditis senza nome:
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Caenorhabditis sp. 1 TAC-2019
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Caenorhabditis sp. 1 TWN1898
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Caenorhabditis sp. 10 JR-2014
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Caenorhabditis sp. 10 TWN510
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Caenorhabditis sp. 11 RJ-2013
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Caenorhabditis sp. 16 NG-2017
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Caenorhabditis sp. 2 KK-2011
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Caenorhabditis sp. 2 TWN2542
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Caenorhabditis sp. 21 LS-2015
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Caenorhabditis sp. 23 dC-2012
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Caenorhabditis sp. 26 LS-2015
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Caenorhabditis sp. 3 TWN2594
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Caenorhabditis sp. 31 LS-2015
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Caenorhabditis sp. 32 LS-2015
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Caenorhabditis sp. 38 MB-2015
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Caenorhabditis sp. 39 LS-2015
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Caenorhabditis sp. 4 TWN1772
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Caenorhabditis sp. 40 LS-2015
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Caenorhabditis sp. 43 LS-2015
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Caenorhabditis sp. 5 GVDU-2019
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Caenorhabditis sp. 6 TWN1824
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Caenorhabditis sp. 7 GVDU-2019
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Caenorhabditis sp. 8 KK-2011
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Caenorhabditis sp. 8 TWN1907
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Caenorhabditis sp. 9 AC-2009
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Caenorhabditis sp. 9 TWN2033
- Caenorhabditis sp. DF5070
- Caenorhabditis sp. JLR-2009
- Caenorhabditis sp. JU727
- Caenorhabditis sp. SB341
Secondo ITIS (27 marzo 2011) :
Genetico
Elenco delle specie sequenziate
Studi filogenetici
Cladogramma delle specie Caenorhabditis secondo Félix et al. (aprile 2014)
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Caenorhabditis
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elegans
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C. inaspettato
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C. sp. 35
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| elegans
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C. wallacei
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C. tropicalis
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C. brenneri
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C. pasteertyi
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C. elegans
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| Japonica
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C. nouraguensis
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C. yunquensis
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C. macrosperma
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C. japonica
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C. kamaaina
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| Drosophile
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C. monodelphis
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C. plicata
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Cladogramma della specie Caenorhabditis , basato sul confronto di sequenze del " Spaziatore trascritto interno ", una porzione di DNA situata tra i geni della subunità piccola e grande dell'RNA.
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Uno studio filogenetico effettuato nel 2014 ha rivelato la presenza di due supergruppi, 'Elegans' e 'Drosophilae, e due gruppi ('Elegans' e 'Japonica') all'interno del supergruppo 'Elegans'. Questo studio rivela anche che C. nigoni è la specie sorella di C. briggsae mentre C. elegans è singolo, basale nel gruppo "Elegans".
Un altro studio del 2019 aggiunge C. inopinata come la specie più vicina a C. elegans . Rivela anche che C. monodelphis è la specie più basale nell'albero filogenetico.
Note e riferimenti
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(in) Osche, G., 1952. "Phylogeny Systematik und der Gattung Rhabditis (Nematoda)." Zoologische Jahrbücher (Abt. 1), 81, p. 190-280 .
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NCBI , consultato il 30 ottobre 2019.
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ITIS , accesso 27 marzo 2011
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(it) Stein, LD et al. , " La sequenza del genoma di Caenorhabditis briggsae : una piattaforma per la genomica comparata " , PLoS Biology , vol. 1, n o 22003, pag. 166–192 ( PMID 14624247 , PMCID 261899 , DOI 10.1371 / journal.pbio.0000045 , leggi online )
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(in) The C. elegans Sequencing Consortium, " Sequenza del genoma del nematode C. elegans : una piattaforma per indagare sulla biologia " , Science , vol. 282,1998, pag. 2012–2018 ( DOI 10.1126 / science.282.5396.2012 , leggi online )
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(in) Felix, Marie-Anne; Braendle, Cristiano; Cutter, Asher D. (11 aprile 2014). "Un sistema semplificato per la diagnosi delle specie in Caenorhabditis (Nematoda: Rhabditidae) con designazioni di nomi per 15 specie biologiche distinte". PLOS UNO. 9: e94723. DOI : 10.1371 / journal.pone.0094723
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(it) Genomica comparativa di 10 nuove specie Caenorhabditis. Lewis Stevens, Marie ‐ Anne Félix, Toni Beltran, Christian Braendle, Carlos Caurcel, Sarah Fausett, David Fitch, Lise Frézal, Charlie Gosse e Taniya Kaur, Evolution Letters, Volume3, Issue2, aprile 2019, pagine 217-236, DOI : 10.1002 /evl3.110 .
link esterno