La variante Beta di SARS-CoV-2 , chiamata anche variante 501.V2 o B.1.351 e soprannominata “ variante sudafricana ”, è una variante considerata altamente trasmissibile di SARS-CoV-2 , il coronavirus responsabile del Covid-19 . Questa variante è stata rilevata in Sudafrica e la sua esistenza è stata resa pubblica dal Dipartimento della Salute (nel) paese il 18 dicembre 2020 . Successivamente è stato osservato anche in Europa, inclusi Regno Unito e Francia.
È stato osservato che la prevalenza di questa variante è maggiore nei giovani senza comorbidità e che porta in questi pazienti a forme più gravi della malattia rispetto alle altre varianti. Il Dipartimento della Salute sudafricano indica anche che questa variante potrebbe essere responsabile della seconda ondata della pandemia di Covid-19 in questo Paese a causa della sua maggiore velocità di diffusione.
Questa variante contiene diverse mutazioni che le consentono di legarsi più facilmente alle cellule umane , in particolare a causa delle seguenti tre mutazioni del peplomero S del virus che interessano il dominio di legame al recettore , o RBD (per il dominio di legame al recettore ), in grado di essendo legante all'enzima di conversione dell'angiotensina 2 (ACE2): una mutazione N501Y (un residuo di asparagina è sostituito con una tirosina in posizione 501) una mutazione K417N (il residuo di una lisina è sostituito da un'asparagina in posizione 417) e un E484K mutazione missenso (un residuo di glutammato è sostituito da una lisina in posizione 484).
La mutazione N501Y è presente anche nella variante VOC-202012/01 osservata alla fine del 2020 nel Regno Unito .
La variante 501.V2 è mutata più della VOC-202012/01 inglese , il che la rende più preoccupante.
Si dice che la variante sudafricana sia un ceppo più contagioso di SARS-CoV-2, che renderebbe più difficile il controllo e potrebbe causare, aritmeticamente, più ricoveri e decessi. La variante sudafricana 501.V2 sembrerebbe essere più contagiosa della variante inglese VOC-202012/01 , quest'ultima essendo già tra il 50% e il 70% più contagiosa del ceppo comune. Questa maggiore contagiosità sarebbe dovuta principalmente alla mutazione N501Y, ma anche alle mutazioni K417N ed E484K, presenti sulla proteina Spike .
La preoccupazione per la resistenza ai vaccini della variante 501.V2 è maggiore rispetto a VOC-202012/01 , che è stato confermato essere suscettibile ai vaccini occidentali, in particolare all'RNA . Il cambiamento della proteina S rilevato dal sistema immunitario è problematico. Esiste infatti, secondo il professor John Bell dell'Università di Oxford , una grande incognita sull'efficacia dei vaccini, che, quantomeno, potrebbe essere ridotta. Le analisi al plasma di persone precedentemente infette avevano dimostrato che il virus ostacolava l'immunità essendo "meno neutralizzato" dai linfociti. Notiamo anche il caso inottobre 2020di una donna brasiliana reinfettata con una variante portatrice di E484K, che poi aveva una forma più grave. Pfizer e Moderna hanno assicurato che il loro vaccino neutralizza un virus che trasporta la mutazione N501Y, ma non sono stati condotti studi per E484K. Questa variante aumenterebbe anche il rischio di reinfezione.
Gli scienziati sono preoccupati per il possibile accumulo di mutazioni in futuro, riducendo gradualmente l'efficacia dei vaccini e richiedendo la loro riformulazione, anche se attualmente la metà di loro rimane ottimista su 501.V2, quindi l'altro è dubbioso.
Uno studio del Qatar pubblicato il 5 maggio 2021 su The New Journal of Medicine che ha coinvolto 37.674 partecipanti ha dimostrato l'efficacia del vaccino BNT162b2 (Pfizer-BioNTech) sul B.1.1.7 (inglese) e B. 1.351 (sudafricano). Per un intervallo di confidenza del 95%, lo studio indica che per un minimo di 14 giorni dopo la seconda dose, l'efficacia è stata dell'89,5% contro le contaminazioni identificate dal test PCR (sintomatiche o meno) per la variante inglese contro il 75% per il sud variante africana. Il vaccino era efficace al 100% contro le forme gravi e fatali per entrambe le varianti. Lo studio suggerisce quindi una riduzione dell'efficacia del vaccino contro la variante sudafricana sulle forme lievi e moderate che non rimette però in discussione l'efficacia contro le forme gravi e fatali sul campione della popolazione studiata.
Questa variante accumula un numero maggiore di mutazioni del solito. Le mutazioni potrebbero essere apparse in un soggetto immunocompromesso , avendo difese più povere e favorendo la moltiplicazione del virus. Tanto più che il Sudafrica ha un tasso di prevalenza dell'AIDS superiore al 20% (per le persone di età compresa tra 15 e 49 anni), in particolare nell'est del paese.
Caso per paese (aggiornato al 28 luglio 2021) GISAID | ||
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Paese | Casi confermati | Data di raccolta |
Algeria | 2 | 25 aprile 2021 |
Angola | 401 | 22 aprile 2021 |
Anguilla | 2 | 4 giugno 2021 |
Argentina | 35 | 24 aprile 2021 |
Armenia | 1 | 25 giugno 2021 |
Aruba | 4 | 10 aprile 2021 |
Australia | 73 | 28 giugno 2021 |
Austria | 260 | 8 giugno 2021 |
Azerbaigian | 1 | 6 febbraio 2021 |
Bahrein | 1 | 9 aprile 2021 |
Bangladesh | 56 | 16 giugno 2021 |
Belgio | 1.075 | 14 giugno 2021 |
Bhutan | 1 | 9 aprile 2021 |
Bosnia Erzegovina | 1 | 11 febbraio 2021 |
Botswana | 342 | 27 giugno 2021 |
Brasile | 6 | 5 aprile 2021 |
Brunei | 1 | 20 gennaio 2021 |
Bulgaria | 2 | 9 giugno 2021 |
Burkina Faso | 2 | 30 maggio 2021 |
Burundi | 2 | 14 maggio 2021 |
Cambogia | 1 | 31 maggio 2021 |
Camerun | 9 | 1 marzo 2021 |
Canada | 860 | 21 giugno 2021 |
Repubblica Centrafricana | 2 | 29 aprile 2021 |
Chile | 4 | 22 maggio 2021 |
Cina | 89 | 4 giugno 2021 |
Colombia | 1 | 13 aprile 2021 |
Costa Rica | 12 | 4 maggio 2021 |
Costa d'Avorio | 1 | 6 marzo 2021 |
Croazia | 41 | |
Repubblica Ceca | 71 | 10 giugno 2021 |
Repubblica Democratica del Congo | 30 | 20 aprile 2021 |
Danimarca | 121 | 29 giugno 2021 |
Gibuti | 22 | 9 aprile 2021 |
Repubblica Dominicana | 2 | 21 maggio 2021 |
Guinea Equatoriale | 43 | 1 aprile 2021 |
Estonia | 37 | 23 aprile 2021 |
Eswatini | 26 | 23 marzo 2021 |
Isole Faroe | 1 | 6 maggio 2021 |
Finlandia | 1.123 | 21 maggio 2021 |
Francia | 2.149 | 23 giugno 2021 |
Guiana francese | 2 | 7 aprile 2021 |
Gabon | 4 | 21 febbraio 2021 |
Georgia | 1 | 23 maggio 2021 |
Germania | 2 231 | 19 giugno 2021 |
Ghana | 17 | 8 aprile 2021 |
Bomba a mano | 2 | 24 febbraio 2021 |
Grecia | 19 | 29 aprile 2021 |
Guadalupa | 4 | 25 maggio 2021 |
Guami | 3 | 28 aprile 2021 |
Guinea Bissau | 1 | 1 febbraio 2021 |
Honduras | 2 | 7 marzo 2021 |
India | 208 | 14 giugno 2021 |
Indonesia | 10 | 2 giugno 2021 |
Iran | 2 | 3 aprile 2021 |
Iraq | 1 | 26 febbraio 2021 |
Irlanda | 69 | 19 aprile 2021 |
Israele | 240 | 28 maggio 2021 |
Italia | 69 | 1 giugno 2021 |
Giamaica | 1 | 7 giugno 2021 |
Giappone | 89 | 13 giugno 2021 |
Giordania | 2 | 18 aprile 2021 |
Kenia | 178 | 31 maggio 2021 |
Kuwait | 1 | 21 giugno 2021 |
Kosovo | 2 | 6 luglio 2021 |
Lettonia | 9 | 13 maggio 2021 |
Lesotho | 14 | 18 gennaio 2021 |
Liberia | 2 | 10 luglio 2021 |
Lituania | 11 | 9 aprile 2021 |
Lussemburgo | 744 | 22 maggio 2021 |
Malawi | 312 | 16 aprile 2021 |
Malaysia | 161 | 10 giugno 2021 |
Malta | 3 | 1 giugno 2021 |
Martinica | 2 | 28 aprile 2021 |
Mauritania | 2 | 5 giugno 2021 |
Mauritius | 7 | 12 marzo 2021 |
Mayotte | 32 | 31 gennaio 2021 |
Messico | 20 | 16 maggio 2021 |
Mozambico | 328 | 22 aprile 2021 |
Namibia | 9 | |
Olanda | 693 | 27 maggio 2021 |
Nuova Zelanda | 31 | 25 giugno 2021 |
Macedonia del Nord | 1 | 10 marzo 2021 |
Isole Marianne settentrionali | 1 | 27 aprile 2021 |
Norvegia | 362 | 11 giugno 2021 |
Pakistan | 35 | 5 giugno 2021 |
Panama | 2 | 12 gennaio 2021 |
Filippine | 1.213 | 8 aprile 2021 |
Polonia | 45 | 7 giugno 2021 |
Portogallo | 99 | 2 giugno 2021 |
Qatar | 650 | 18 maggio 2021 |
L'incontro | 400 | 19 giugno 2021 |
Romania | 7 | 26 maggio 2021 |
Russia | 23 | 12 giugno 2021 |
Ruanda | 39 | 15 giugno 2021 |
Arabia Saudita | 3 | 15 aprile 2021 |
Saint Kitts e Nevis | 1 | 28 febbraio 2021 |
Seychelles | 2 | 14 marzo 2021 |
Singapore | 100 | 25 giugno 2021 |
Saint-Martin | 1 | 24 marzo 2021 |
Slovacchia | 31 | 27 maggio 2021 |
Slovenia | 31 | 6 aprile 2021 |
Somalia | 1 | |
Sud Africa | 6.154 | 21 giugno 2021 |
Corea del Sud | 19 | 17 aprile 2021 |
Sudan del Sud | 3 | 24 aprile 2021 |
Spagna | 588 | 18 giugno 2021 |
Sri Lanka | 4 | 26 marzo 2021 |
Suriname | 5 | 31 marzo 2021 |
Svezia | 2.322 | 17 giugno 2021 |
svizzero | 225 | 22 giugno 2021 |
Taiwan | 3 | 26 aprile 2021 |
Tailandia | 40 | 25 maggio 2021 |
Andare | 2 | 5 febbraio 2021 |
Trinidad e Tobago | 2 | 8 giugno 2021 |
Tunisia | 1 | 24 aprile 2021 |
tacchino | 912 | 24 maggio 2021 |
Uganda | 13 | 2 aprile 2021 |
Emirati Arabi Uniti | 6 | 27 aprile 2021 |
UK | 812 | 24 giugno 2021 |
stati Uniti | 2 454 | 28 giugno 2021 |
Venezuela | 1 | 6 gennaio 2021 |
Wallis e futuna | 1 | 22 febbraio 2021 |
Zambia | 161 | 28 aprile 2021 |
Zimbabwe | 331 | 26 febbraio 2021 |
Mondo (125 paesi) | Totale: 28.452 | Totale al 28 luglio 2021 |