Le principali religioni in Eritrea sono il cristianesimo e l' islam , tra le quali la popolazione del paese è equamente divisa. La maggior parte dei cristiani eritrei fa parte della Chiesa ortodossa eritrea , una chiesa monofisita in comunione con le sue controparti etiope (da cui si è separata nel 1993) ed egiziana (da cui si è separata nel 1952). I musulmani si riferiscono principalmente al sunnismo e alla scuola shafi'i .
Dal 2002, tutti i gruppi religiosi sono stati banditi ad eccezione di cinque gruppi autorizzati dallo Stato:
Secondo il Rapporto annuale 2006 sulla libertà di religione nel mondo , i membri di gruppi non autorizzati (evangelici indipendenti, pentecostali, testimoni di Geova, ecc.) E membri del movimento riformista della Chiesa ortodossa eritrea vengono molestati e imprigionati. Secondo Amnesty International , dozzine di membri di questi movimenti sono detenuti per aver praticato la loro religione. Possono essere torturati o costretti a convertirsi.
Nel 2005, il patriarca della Chiesa ortodossa eritrea Antoine I er è stato presentato istanza di protesta contro l'arresto di tre sacerdoti ortodossi; è stato sostituito da un patriarca nominato dal governo.