Questo articolo tratta della fauna dei Pirenei , specie selvatiche endemiche e specie domestiche o razze native della regione.
La fauna dei Pirenei presenta diversi esempi eclatanti di endemismo: Il Desman dei Pirenei può essere trovato solo in alcuni fiumi e pendii settentrionali della catena, solo un'altra specie appartenente allo stesso genere essendo confinata ai fiumi del Caucaso , nel sud Russia. L' euprocte dei Pirenei ( Calotriton asper ), cugino endemico della salamandra, vive anche nei fiumi e nei laghi situati ad alta quota. Tra le altre peculiarità della fauna pirenaica vi sono gli insetti ciechi delle grotte dell'Ariège, i generi principali sono Anophthalmus e Adelops .
Lo stambecco dei Pirenei si estinse misteriosamente nelgennaio 2000, come per l'orso bruno autoctono dei Pirenei, è stato cacciato fino alla sua quasi estinzione negli anni 90, si cerca dal 1996 di salvare la specie con la reintroduzione degli orsi portati dalla Slovenia.