Eco RI (Eco "R" un) è un enzima di restrizione prodotto dal ceppo batterico Escherichia coli , un batterio commensale dell'apparato digerente umano . Il suo sito di riconoscimento è il seguente:
5'-GAATTC-3' 3'-CTTAAG-5'Il più delle volte, i siti di restrizione sono palindromici , cioè la sequenza del DNA è la stessa quando viene letta dalla direzione da 5 'a 3'.
È un'endonucleasi di restrizione di tipo II, molto comune nei batteri.
EcoRI si muove scivolando lungo la spina dorsale fosfato-zucchero del DNA. EcoRI può legarsi al DNA in 2 modi: in un modo specifico al suo sito di riconoscimento, immobile, che porta alla scissione del DNA, e in un modo più sciolto e non specifico, che ne consente lo spostamento. Questi 2 modi vengono applicati alternativamente e continuamente.
Il taglio nel DNA sarà spostato su ogni filamento da pochi nucleotidi. Si dice che il taglio generi estremità coesive (al contrario delle estremità smussate dove non c'è spostamento nel taglio, ottenuto da EcoRV, un altro enzima di restrizione).