L'ex Collegio dei Gesuiti , con la sua chiesa di San Giovanni Battista, era un'istituzione educativa cattolica fondata a Messina ( Sicilia ) nel 1548 dai Gesuiti , su iniziativa stessa di Sant'Ignazio di Loyola . Primo collegio fondato dai Gesuiti, si trasferì nei nuovi edifici costruiti da Natale Masuccio nel 1608. Gravemente danneggiati dal terremoto del 1908, gli edifici furono demoliti nel 1913 .
I Gesuiti sono presenti nella città di Messina dal 1548. A loro è stata affidata la Chiesa di San Nicola. Su richiesta insistente di Juan de Vega, viceré di Sicilia, Sant'Ignazio di Loyola accettò di aprire un collegio lì. È il primo collegio fondato dai gesuiti. Consapevole che si tratta di una svolta importante nelle scelte apostoliche assunte dalla Compagnia di Gesù Ignazio di Loyola dà una certa solennità all'evento. I dieci gesuiti inviati a Messina sotto la direzione di Jérôme Nadal chiedono e ottengono la benedizione del Papa prima di lasciare Roma.
Cornelius Wischaven, che faceva parte di questo gruppo fondatore, aprì due anni dopo il primo noviziato della Compagnia di Gesù (1550) sempre a Messina, che rimarrà annesso al collegio per alcuni anni. Wischaven è il suo primo maestro alle prime armi.
Il collegio si dice sia ' Primum Prototypum Collegium perché sarà il modello che seguiranno le innumerevoli istituzioni educative che l'ordine dei Gesuiti fondò in tutto il mondo, al punto che diventerà, agli occhi di molti, la caratteristica principale delle sue attività nel mondo all'interno della chiesa.
Il collegio riscosse subito un grande successo e il numero dei suoi alunni in rapida crescita, nel 1608 furono eretti nuovi edifici su progetto architettonico del gesuita Natale Masuccio . Nel tempo il collegio diventa il Messanense Studium Generale , che è di fatto l'embrione dell'Università degli Studi di Messina.
Quando, nel 1767 , i gesuiti furono espulsi dal Regno di Napoli , Sicilia e Palermo (il cui sovrano faceva parte della famiglia Borbone ), il collegio continuò a funzionare - senza gesuiti - come "Accademia Carolina". Danneggiati dal terremoto del 1783, gli edifici furono restaurati e, dal 1839, ospitarono l'Università Ferdinando I ,
Un nuovo e più grave terremoto , nel 1908, fu fatale per tutti gli edifici. E 'tuttora in piedi è demolita nel 1913. Non è rimasta traccia se non il suo cancello di ingresso sopravvissuto al disastro e che fa parte del complesso di edifici della nuova Università di Messina eretto dove era il vecchio collegio.
I gesuiti italiani ripresero la loro tradizione pedagogica a Messina nel 1884, dapprima sotto la direzione di una scuola "Maurolico". Il collegio si chiama oggi "Sant'Ignazio" e si trova in un altro sito, sulla "via Ignatianum" di Messina.