Il cristianesimo in Azerbaigian è una religione minoritaria. I cristiani rappresentano il 4,8% della popolazione del Paese. Il 2,5% della popolazione appartiene alla Chiesa ortodossa russa (1998), affiliata a un'Eparchia ortodossa russa.
Il cristianesimo si è diffuso nell'Albania del Caucaso, che è il territorio dell'Azerbaigian in tempi apostolici. La prima tappa di questo periodo si chiama periodo degli apostoli Bartolomeo e Taddeo , che diffusero la nuova religione con la benedizione del primo patriarca di Gerusalemme per poi dare alla luce la Chiesa albanese . La prima chiesa fu eretta nel villaggio di Kich. La chiesa di Kish fu costruita prima della prima chiesa cristiana armena.
Il numero dei protestanti è stimato in meno di 7.000. C'è una comunità luterana tedesca a Baku .
Missionari cattolici arrivarono in Azerbaijan dal XIV ° secolo. Agli inizi del XX ° secolo, l'Azerbaigian , vissuto in Baku una comunità di decine di migliaia di cattolici polacchi , russo e tedesco . L'unica chiesa (costruita nel 1912) fu chiusa all'arrivo dei bolscevichi e poi demolita nel 1931 ; il suo prete è stato assassinato. Tuttavia nel 1992 un prete slovacco venne a Baku per fondare una comunità. Papa Giovanni Paolo II ha visitato l'Azerbaigian nel 2002 . Oggi la comunità cattolica conta 400 fedeli indigeni e mille stranieri vivono in Azerbaigian . Esiste solo una parrocchia.
Ci sono undici comunità. I Moloques sono una minoranza cristiana che, come i protestanti nell'Europa occidentale , centrano le loro convinzioni sulla Bibbia e rifiutano la gerarchia delle chiese.